RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557654.5

GPHN-215, Transcript of gephyrin, human

TSL 4

Gene GPHN, Length 503 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPHN-215	ENST00000557654	CLCN3	P51790	818 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	ZNF280D	Q6N043	979 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	TMEM219	Q86XT9	240 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	BRF2	Q9HAW0	419 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	NCOA1	Q15788	1441 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	LRRC53	A6NM62	1247 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	LINC01565	O15544	149 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	TGFB1I1	O43294	461 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	CDH1	P12830	882 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	S1PR1	P21453	382 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	KCNA5	P22460	613 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	MT3	P25713	68 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	CLCNKA	P51800	687 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	GSTA3	Q16772	222 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	STPG1	Q5TH74	334 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	WDR63	Q8IWG1	891 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	GTF3C6	Q969F1	213 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	SAAL1	Q96ER3	474 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	PIP5K1A	Q99755	562 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	PADI1	Q9ULC6	663 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654		A0A0B4J293	547 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	MYOD1	P15172	320 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	ISL1	P61371	349 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	ORAI1	Q96D31	301 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	AKNA	Q7Z591	1439 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	EGF	P01133	1207 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	HOXB5	P09067	269 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	TROAP	Q12815	778 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	CCDC96	Q2M329	555 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	PPM1E	Q8WY54	764 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	FEM1C	Q96JP0	617 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	EPYC	Q99645	322 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	PADI3	Q9ULW8	664 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	NUDC	Q9Y266	331 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GPHN-215	ENST00000557654	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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