RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557413.5

RPS6KL1-216, Transcript of ribosomal protein S6 kinase like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RPS6KL1, Length 2,425 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1-216ENST00000557413 C7P10643 843 aa20.6■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 FCGR1AP12314 374 aa20.6■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 LBPP18428 481 aa20.6■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 RENBPP51606 427 aa20.6■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa20.6■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 FAM171BQ6P995 826 aa20.6■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 BEND5Q7L4P6 421 aa20.6■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 LPPQ93052 612 aa20.6■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 SMOC2Q9H3U7 446 aa20.6■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 TUBB1Q9H4B7 451 aa20.6■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 NUDT5Q9UKK9 219 aa20.6■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa20.6■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 HS3ST4Q9Y661 456 aa20.6■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa20.59■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 LINC00032P0C843 101 aa20.59■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 FDXRP22570 491 aa20.59■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 PGFP49763 221 aa20.59■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 PSEN2P49810 448 aa20.59■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 IFNEQ86WN2 208 aa20.59■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 SMYD1Q8NB12 490 aa20.59■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 KLHL5Q96PQ7 755 aa20.59■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 C8orf4Q9NR00 106 aa20.59■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 POLG2Q9UHN1 485 aa20.59■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 BTRCQ9Y297 605 aa20.59■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 ZNF510Q9Y2H8 683 aa20.59■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 KCTD3Q9Y597 815 aa20.59■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 H3BMQ9 156 aa20.59■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 DSC2Q02487 901 aa20.59■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 FOXM1Q08050 763 aa20.59■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 SLC10A7Q0GE19 358 aa20.59■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 GRB14Q14449 540 aa20.59■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 OR4D1Q15615 310 aa20.59■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa20.59■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 DNAJB14Q8TBM8 379 aa20.59■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 COG8Q96MW5 612 aa20.59■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 ACBD6Q9BR61 282 aa20.59■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 ALG2Q9H553 416 aa20.59■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 FAIMQ9NVQ4 179 aa20.59■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 IDO1P14902 403 aa20.58■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 VARSP26640 1264 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 TTKP33981 857 aa20.58■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 SLC5A3P53794 718 aa20.58■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 RAB39AQ14964 217 aa20.58■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 COQ5Q5HYK3 327 aa20.58■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 GPR107Q5VW38 600 aa20.58■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 Q6ZNX1 250 aa20.58■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 DHRSXQ8N5I4 330 aa20.58■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 THAP11Q96EK4 314 aa20.58■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 TRIM54Q9BYV2 358 aa20.58■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 FAM105AQ9NUU6 356 aa20.58■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 J3KR12 359 aa20.58■□□□□ 0.88
RPS6KL1-216ENST00000557413 MMP2P08253 660 aa20.58■□□□□ 0.88
RPS6KL1-216ENST00000557413 SLC2A3P11169 496 aa20.58■□□□□ 0.88
RPS6KL1-216ENST00000557413 ODC1P11926 461 aa20.58■□□□□ 0.88
RPS6KL1-216ENST00000557413 MTHFD2P13995 350 aa20.58■□□□□ 0.88
RPS6KL1-216ENST00000557413 HMOX2P30519 316 aa20.58■□□□□ 0.88
RPS6KL1-216ENST00000557413 CAPGP40121 348 aa20.58■□□□□ 0.88
RPS6KL1-216ENST00000557413 SCNN1GP51170 649 aa20.58■□□□□ 0.88
RPS6KL1-216ENST00000557413 APLP1P51693 650 aa20.58■□□□□ 0.88
RPS6KL1-216ENST00000557413 IHHQ14623 411 aa20.58■□□□□ 0.88
RPS6KL1-216ENST00000557413 SIRPB2Q5JXA9 342 aa20.58■□□□□ 0.88
RPS6KL1-216ENST00000557413 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
RPS6KL1-216ENST00000557413 MARC1Q5VT66 337 aa20.58■□□□□ 0.88
RPS6KL1-216ENST00000557413 ZNF549Q6P9A3 640 aa20.58■□□□□ 0.88
RPS6KL1-216ENST00000557413 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa20.58■□□□□ 0.88
RPS6KL1-216ENST00000557413 TLK2Q86UE8 772 aa20.58■□□□□ 0.88
RPS6KL1-216ENST00000557413 CPNE9Q8IYJ1 553 aa20.58■□□□□ 0.88
RPS6KL1-216ENST00000557413 NPLOC4Q8TAT6 608 aa20.58■□□□□ 0.88
RPS6KL1-216ENST00000557413 TMEM125Q96AQ2 219 aa20.58■□□□□ 0.88
RPS6KL1-216ENST00000557413 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa20.58■□□□□ 0.88
RPS6KL1-216ENST00000557413 TBCCD1Q9NVR7 557 aa20.58■□□□□ 0.88
RPS6KL1-216ENST00000557413 ARL5CA6NH57 179 aa20.57■□□□□ 0.88
RPS6KL1-216ENST00000557413 SNAP91O60641 907 aa20.57■□□□□ 0.88
RPS6KL1-216ENST00000557413 DCKP27707 260 aa20.57■□□□□ 0.88
RPS6KL1-216ENST00000557413 RFC2P35250 354 aa20.57■□□□□ 0.88
RPS6KL1-216ENST00000557413 GSK3BP49841 420 aa20.57■□□□□ 0.88
RPS6KL1-216ENST00000557413 DIO3P55073 304 aa20.57■□□□□ 0.88
RPS6KL1-216ENST00000557413 NFYCQ13952 458 aa20.57■□□□□ 0.88
RPS6KL1-216ENST00000557413 UPP1Q16831 310 aa20.57■□□□□ 0.88
RPS6KL1-216ENST00000557413 SPATS1Q496A3 300 aa20.57■□□□□ 0.88
RPS6KL1-216ENST00000557413 CYBRD1Q53TN4 286 aa20.57■□□□□ 0.88
RPS6KL1-216ENST00000557413 RABL3Q5HYI8 236 aa20.57■□□□□ 0.88
RPS6KL1-216ENST00000557413 TRIM74Q86UV6 250 aa20.57■□□□□ 0.88
RPS6KL1-216ENST00000557413 TRIM73Q86UV7 250 aa20.57■□□□□ 0.88
RPS6KL1-216ENST00000557413 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.6 ms