RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551984.5

FGD4-215, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4, human

TSL 5

Gene FGD4, Length 2,435 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FGD4-215	ENST00000551984	CD27	P26842	260 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	MATK	P42679	507 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	GRIA4	P48058	902 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	SERPINB8	P50452	374 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	SNX16	P57768	344 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	FBXL22	Q6P050	247 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	GLRX5	Q86SX6	157 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	NAXD	Q8IW45	347 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	ART4	Q93070	314 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	NT5C3B	Q969T7	300 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	BIRC7	Q96CA5	298 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	NPY6R	Q99463	290 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	GAN	Q9H2C0	597 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	TM9SF3	Q9HD45	589 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	TBK1	Q9UHD2	729 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	FZD4	Q9ULV1	537 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	NENF	Q9UMX5	172 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984		A0A1B0GVT2	93 aa		6.52	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	MID1	O15344	667 aa		6.52	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	PHF2	O75151	1096 aa		6.52	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	GRAP2	O75791	330 aa		6.52	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	PDE5A	O76074	875 aa		6.52	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	ZWINT	O95229	277 aa		6.52	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	IGHV4-34	P06331	123 aa		6.52	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	PDGFRA	P16234	1089 aa		6.52	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	ABCB4	P21439	1286 aa		6.52	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	CXCR3	P49682	368 aa		6.52	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	PDE1B	Q01064	536 aa		6.52	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	CST6	Q15828	149 aa		6.52	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	BCL2A1	Q16548	175 aa		6.52	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		6.52	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	HLA-B	Q31612	363 aa		6.52	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	ARTN	Q5T4W7	220 aa		6.52	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		6.52	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	TTC27	Q6P3X3	843 aa		6.52	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		6.52	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		6.52	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		6.52	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	RFX8	Q6ZV50	586 aa		6.52	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	BNIPL	Q7Z465	357 aa		6.52	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		6.52	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	FRS2	Q8WU20	508 aa		6.52	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	IGSF8	Q969P0	613 aa		6.52	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		6.52	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	CDK15	Q96Q40	435 aa		6.52	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		6.52	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	STK33	Q9BYT3	514 aa		6.52	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	GAREM1	Q9H706	876 aa		6.52	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	IL21R	Q9HBE5	538 aa		6.52	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		6.52	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		6.52	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		6.52	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		6.52	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		6.52	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	AKAP13	Q12802	2813 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FGD4-215	ENST00000551984	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FGD4-215	ENST00000551984	DOCK9	Q9BZ29	2069 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FGD4-215	ENST00000551984	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FGD4-215	ENST00000551984	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37
FGD4-215	ENST00000551984	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FGD4-215	ENST00000551984	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FGD4-215	ENST00000551984	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FGD4-215	ENST00000551984		E9PBE3	544 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FGD4-215	ENST00000551984	TP73	O15350	636 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FGD4-215	ENST00000551984	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
FGD4-215	ENST00000551984	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37
FGD4-215	ENST00000551984	USP1	O94782	785 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FGD4-215	ENST00000551984	C1QTNF9	P0C862	333 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FGD4-215	ENST00000551984	GSTT2	P0CG29	244 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FGD4-215	ENST00000551984	GSTT2B	P0CG30	244 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FGD4-215	ENST00000551984	SMIM18	P0DKX4	95 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FGD4-215	ENST00000551984	CYP11B1	P15538	503 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FGD4-215	ENST00000551984	SPINK2	P20155	84 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FGD4-215	ENST00000551984	PCSK6	P29122	969 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FGD4-215	ENST00000551984	CTSK	P43235	329 aa		6.52	□□□□□ -1.37

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