RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	ODF2	Q5BJF6	829 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	DENND2C	Q68D51	928 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	NRROS	Q86YC3	692 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	RFX6	Q8HWS3	928 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	KY	Q8NBH2	561 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	EXD1	Q8NHP7	514 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	SCAMP4	Q969E2	229 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	TEKT5	Q96M29	485 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	SMIM14	Q96QK8	99 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	GULP1	Q9UBP9	304 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	AK5	Q9Y6K8	562 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137		A0A0U1RQS6	177 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	CST8	O60676	142 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	CLDN7	O95471	211 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	EPO	P01588	193 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	SPINT3	P49223	89 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	PDX1	P52945	283 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	COPS2	P61201	443 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	11.43	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	LRP8	Q14114	963 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	NR1D2	Q14995	579 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	NPNT	Q6UXI9	565 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	CCDC74A	Q96AQ1	378 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	HIC2	Q96JB3	615 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	WDR24	Q96S15	920 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	VAT1	Q99536	393 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	GLOD4	Q9HC38	313 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	RAD18	Q9NS91	495 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	VPS18	Q9P253	973 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	SUFU	Q9UMX1	484 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	LHX6	Q9UPM6	363 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	11.43	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137		A0A1W2PNU3	283 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137		A0A1W2PQM1	296 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	RCCD1	A6NED2	376 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	PJA2	O43164	708 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	PTPN3	P26045	913 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	PTPN7	P35236	360 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	ADCY8	P40145	1251 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	DCDC1	P59894	354 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	CDK18	Q07002	472 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	ADCY2	Q08462	1091 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	WASHC5	Q12768	1159 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	XRCC4	Q13426	336 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	SPIDR	Q14159	915 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	PYCR3	Q53H96	274 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	BBS12	Q6ZW61	710 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	11.42	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	P3H4	Q92791	437 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	EID2B	Q96D98	161 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	AGAP3	Q96P47	875 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	AGAP2	Q99490	1192 aa		11.42	□□□□□ -0.58

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