RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550446.5

LETMD1-224, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene LETMD1, Length 562 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-224	ENST00000550446	SLC28A2	O43868	658 aa		18.89	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	IVL	P07476	585 aa		18.89	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	SERPINB6	P35237	376 aa		18.89	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	ZNF165	P49910	485 aa		18.89	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	MMRN1	Q13201	1228 aa		18.89	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		18.89	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		18.89	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		18.89	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	TEKT4	Q8WW24	435 aa		18.89	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	18.89	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	AP2M1	Q96CW1	435 aa		18.89	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	18.89	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	ABCG8	Q9H221	673 aa		18.89	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		18.89	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	PPIL1	Q9Y3C6	166 aa		18.89	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		18.88	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	PPM1D	O15297	605 aa		18.88	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	IL4R	P24394	825 aa		18.88	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	MPST	P25325	297 aa		18.88	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	TEAD1	P28347	426 aa		18.88	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	ACTR1B	P42025	376 aa		18.88	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	GPR3	P46089	330 aa		18.88	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	EPHB1	P54762	984 aa		18.88	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	ACTR1A	P61163	376 aa		18.88	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	CYP4F2	P78329	520 aa		18.88	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	PTS	Q03393	145 aa		18.88	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	DPT	Q07507	201 aa		18.88	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	NFATC3	Q12968	1075 aa		18.88	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	PEX6	Q13608	980 aa		18.88	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	NFKBIB	Q15653	356 aa		18.88	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		18.88	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	LRRC66	Q68CR7	880 aa		18.88	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	TRIM74	Q86UV6	250 aa		18.88	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	NAGS	Q8N159	534 aa		18.88	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	TEX26	Q8N6G2	289 aa		18.88	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	SCAMP4	Q969E2	229 aa		18.88	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		18.88	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	NUP85	Q9BW27	656 aa		18.88	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		18.88	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	CD48	P09326	243 aa		18.87	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	18.87	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	18.87	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	18.87	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	18.87	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	NR1D2	Q14995	579 aa		18.87	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		18.87	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		18.87	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		18.87	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	DTX1	Q86Y01	620 aa		18.87	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		18.87	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		18.87	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	FAM117A	Q9C073	453 aa		18.87	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	CDH19	Q9H159	772 aa		18.87	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		18.87	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		18.87	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	18.87	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	MYO1F	O00160	1098 aa		18.86	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	FZD6	O60353	706 aa		18.86	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	SOD1	P00441	154 aa		18.86	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	ITGB2	P05107	769 aa		18.86	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	FAM87A	P0C7U9	286 aa		18.86	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	CD82	P27701	267 aa		18.86	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	LIMK2	P53671	638 aa		18.86	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	DSC2	Q02487	901 aa		18.86	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	18.86	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		18.86	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		18.86	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	18.86	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	OR2M4	Q96R27	311 aa		18.86	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	TAAR9	Q96RI9	348 aa		18.86	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	AGAP2	Q99490	1192 aa		18.86	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	18.86	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	18.86	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		18.86	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	CHKB	Q9Y259	395 aa		18.86	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	18.86	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	18.86	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446		A0A0J9YYE9	177 aa		18.85	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	18.85	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	INPP4B	O15327	924 aa		18.85	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	MAP3K6	O95382	1288 aa		18.85	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	ASMTL	O95671	621 aa		18.85	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	TRBC1	P01850	177 aa		18.85	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	CYP1A2	P05177	515 aa		18.85	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	GJC1	P36383	396 aa		18.85	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	18.85	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	KCNC4	Q03721	635 aa		18.85	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	IHH	Q14623	411 aa		18.85	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	TBR1	Q16650	682 aa		18.85	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	18.85	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	PYCR3	Q53H96	274 aa		18.85	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	FIGN	Q5HY92	759 aa		18.85	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	18.85	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	XKR5	Q6UX68	686 aa		18.85	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		18.85	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	EXD1	Q8NHP7	514 aa		18.85	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		18.85	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	18.85	■□□□□ 0.61

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.7 ms