RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 CTPS1P17812 591 aa16.93■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 AMPD1P23109 780 aa16.93■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 TEAD1P28347 426 aa16.93■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 ARL4AP40617 200 aa16.93■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 TLE1Q04724 770 aa16.93■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 SQSTM1Q13501 440 aa16.93■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 ARMC12Q5T9G4 340 aa16.93■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 TMEM71Q6P5X7 295 aa16.93■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 SASS6Q6UVJ0 657 aa16.93■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 USP45Q70EL2 814 aa16.93■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 FAM129CQ86XR2 697 aa16.93■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 NRSN1Q8IZ57 195 aa16.93■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 FNIP1Q8TF40 1166 aa16.93■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 DPYSL5Q9BPU6 564 aa16.93■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 MGME1Q9BQP7 344 aa16.93■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 SYT11Q9BT88 431 aa16.93■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 DDA1Q9BW61 102 aa16.93■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa16.93■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 ETNK2Q9NVF9 386 aa16.93■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 TMEM9Q9P0T7 183 aa16.93■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 SPTA1P02549 2419 aa16.93■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 A0A0U1RQS6 177 aa16.92■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 EFCAB7A8K855 629 aa16.92■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 RAD1O60671 282 aa16.92■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 MAFKO60675 156 aa16.92■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 PGLSO95336 258 aa16.92■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 FTLP02792 175 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 CSF2RBP32927 897 aa16.92■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 POLE2P56282 527 aa16.92■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 KCNAB2Q13303 367 aa16.92■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 SMTNL2Q2TAL5 461 aa16.92■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 COLEC12Q5KU26 742 aa16.92■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 DCAF12Q5T6F0 453 aa16.92■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 MARC1Q5VT66 337 aa16.92■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 TMCO3Q6UWJ1 677 aa16.92■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 RFLNAQ6ZTI6 216 aa16.92■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa16.92■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 NDUFAF2Q8N183 169 aa16.92■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 HSPH1Q92598 858 aa16.92■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 AP2M1Q96CW1 435 aa16.92■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 OR2M4Q96R27 311 aa16.92■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 SLC38A3Q99624 504 aa16.92■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 ABCG8Q9H221 673 aa16.92■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 LMBRD1Q9NUN5 540 aa16.92■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 ANO10Q9NW15 660 aa16.92■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 MYO1AQ9UBC5 1043 aa16.92■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 ATP1A3P13637 1013 aa16.91■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 MMP13P45452 471 aa16.91■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 CCR10P46092 362 aa16.91■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 GPLD1P80108 840 aa16.91■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 DPTQ07507 201 aa16.91■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 RALGPS1Q5JS13 557 aa16.91■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 SNAP47Q5SQN1 464 aa16.91■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 TRIM74Q86UV6 250 aa16.91■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 ATPAF2Q8N5M1 289 aa16.91■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 PIH1D2Q8WWB5 315 aa16.91■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 ZNF653Q96CK0 615 aa16.91■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 HAUS4Q9H6D7 363 aa16.91■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 MYO6Q9UM54 1294 aa16.91■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 SCINQ9Y6U3 715 aa16.91■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 NAV2Q8IVL1 2488 aa16.9■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 LRRC53A6NM62 1247 aa16.9■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 A8MU76 341 aa16.9■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 B4E171 279 aa16.9■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 ASMTLO95671 621 aa16.9■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 SOD1P00441 154 aa16.9■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 PDHA1P08559 390 aa16.9■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 IL1R2P27930 398 aa16.9■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 PCK1P35558 622 aa16.9■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 TSPAN7P41732 249 aa16.9■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 CDH6P55285 790 aa16.9■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 RAB15P59190 212 aa16.9■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 ITKQ08881 620 aa16.9■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 ASIC2Q16515 512 aa16.9■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 DPYSL2Q16555 572 aa16.9■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 PYCR3Q53H96 274 aa16.9■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 BOLA3Q53S33 107 aa16.9■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 LRRC66Q68CR7 880 aa16.9■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 ANKS6Q68DC2 871 aa16.9■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa16.9■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 POLNQ7Z5Q5 900 aa16.9■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 GALNT13Q8IUC8 556 aa16.9■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 OR10G6Q8NH81 332 aa16.9■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 SCAMP4Q969E2 229 aa16.9■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 CATSPER2Q96P56 530 aa16.9■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 NT5MQ9NPB1 228 aa16.9■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 PPIL1Q9Y3C6 166 aa16.9■□□□□ 0.3
CS-214ENST00000548849 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms