RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533836.1

BTF3L4-208, Transcript of basic transcription factor 3 like 4, human

TSL 4

Gene BTF3L4, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BTF3L4-208	ENST00000533836	TNFAIP1	Q13829	316 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BTF3L4-208	ENST00000533836	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67
BTF3L4-208	ENST00000533836	KIF19	Q2TAC6	998 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BTF3L4-208	ENST00000533836	CDON	Q4KMG0	1287 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BTF3L4-208	ENST00000533836	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BTF3L4-208	ENST00000533836	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BTF3L4-208	ENST00000533836	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BTF3L4-208	ENST00000533836	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BTF3L4-208	ENST00000533836	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BTF3L4-208	ENST00000533836	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BTF3L4-208	ENST00000533836	TANK	Q92844	425 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BTF3L4-208	ENST00000533836	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BTF3L4-208	ENST00000533836	MAF1	Q9H063	256 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BTF3L4-208	ENST00000533836	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BTF3L4-208	ENST00000533836	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BTF3L4-208	ENST00000533836	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BTF3L4-208	ENST00000533836	SIX4	Q9UIU6	781 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BTF3L4-208	ENST00000533836	ZNF580	Q9UK33	172 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BTF3L4-208	ENST00000533836	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BTF3L4-208	ENST00000533836	PLSCR5	A0PG75	271 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	MID1	O15344	667 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	TIPRL	O75663	272 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	PMS2P2	O95744	297 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	EGF	P01133	1207 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	LINC00271	P0C7V0	271 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	BDKRB2	P30411	391 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	CCKBR	P32239	447 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	CLCN3	P51790	818 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	CLCNKA	P51800	687 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	FOXM1	Q08050	763 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	RGMB	Q6NW40	437 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	SGCD	Q92629	289 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	BICD1	Q96G01	975 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	C1orf74	Q96LT6	269 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	MALT1	Q9UDY8	824 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	WDR81	Q562E7	1941 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	C1orf226	A1L170	272 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	HCRTR2	O43614	444 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	ZBED6	P86452	979 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	FRG2	Q64ET8	278 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	LMO3	Q8TAP4	145 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	USP6NL	Q92738	828 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	ORAI1	Q96D31	301 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	IGSF21	Q96ID5	467 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	MTMR6	Q9Y217	621 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	VDAC3	Q9Y277	283 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	SLC16A5	O15375	505 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	JRK	O75564	520 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	RARG	P13631	454 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	MAPK4	P31152	587 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	PIK3CA	P42336	1068 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	GRIK2	Q13002	908 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	COASY	Q13057	564 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	ADIPOQ	Q15848	244 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	ZNF280D	Q6N043	979 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	SARM1	Q6SZW1	724 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	BEST3	Q8N1M1	668 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	TMEM19	Q96HH6	336 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BTF3L4-208	ENST00000533836	DUX5	Q96PT3	197 aa		4.56	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms