RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	SH3BP2	P78314	561 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	NFATC2	Q13469	925 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	STIM1	Q13586	685 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	SEMA5A	Q13591	1074 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	MAP7	Q14244	749 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	NAA35	Q5VZE5	725 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	DENND2C	Q68D51	928 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557		Q6ZVL8	140 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	PRR7	Q8TB68	274 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	NUS1	Q96E22	293 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	C19orf60	Q96EN9	201 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	SLC38A3	Q99624	504 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	ZPBP	Q9BS86	351 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM51	Q9NW97	253 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	ZFHX3	Q15911	3703 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	ZW10	O43264	779 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	KRT86	O43790	486 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	CREG1	O75629	220 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	GFER	P55789	205 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	RIPPLY3	P57055	190 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	GRM3	Q14832	879 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	PARP15	Q460N3	678 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	PYCR3	Q53H96	274 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	CFAP58	Q5T655	872 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	STRADA	Q7RTN6	431 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	OR10G6	Q8NH81	332 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	NTAN1	Q96AB6	310 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	DTD2	Q96FN9	168 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	FAM81B	Q96LP2	452 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	PHF12	Q96QT6	1004 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	AGAP2	Q99490	1192 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	ULBP3	Q9BZM4	244 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	DONSON	Q9NYP3	566 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	OGFR	Q9NZT2	677 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	APC	P25054	2843 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	BICDL2	A1A5D9	508 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	PIPSL	A2A3N6	862 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	CREB3	O43889	395 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	KIAA0754	O94854	1291 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	TIAF1	O95411	115 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	CHRNB2	P17787	502 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	SERPINA4	P29622	427 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	SDC4	P31431	198 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	PTPN9	P43378	593 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	BCL2L1	Q07817	233 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	PTP4A2	Q12974	167 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	PAK1	Q13153	545 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	OR2M4	Q96R27	311 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	PDZD2	O15018	2839 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557		A6NCN8	305 aa		12.05	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	MMP8	P22894	467 aa		12.05	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	MAPK9	P45984	424 aa		12.05	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	HHEX	Q03014	270 aa		12.05	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	FOXM1	Q08050	763 aa		12.05	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	LAMB3	Q13751	1172 aa		12.05	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	IYD	Q6PHW0	289 aa		12.05	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	WDR59	Q6PJI9	974 aa		12.05	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		12.05	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		12.05	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	CT55	Q8WUE5	264 aa		12.05	□□□□□ -0.48
BBS1-222	ENST00000533557	SCAMP4	Q969E2	229 aa		12.05	□□□□□ -0.48

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