RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529778.5

APBB1-208, Transcript of amyloid beta precursor protein binding family B member 1, human

TSL 5

Gene APBB1, Length 893 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APBB1-208	ENST00000529778	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		13.45	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		13.45	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		13.45	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		13.45	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	PSKH2	Q96QS6	385 aa		13.45	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	THAP2	Q9H0W7	228 aa		13.45	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	ISCU	Q9H1K1	167 aa		13.45	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	WDR26	Q9H7D7	661 aa		13.45	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		13.45	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	FGF22	Q9HCT0	170 aa		13.45	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		13.45	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		13.45	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		13.44	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	SYCE3	A1L190	88 aa		13.44	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	PRR19	A6NJB7	356 aa		13.44	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778		D6RAR5	112 aa		13.44	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	CP	P00450	1065 aa		13.44	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	JMJD7	P0C870	316 aa		13.44	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	ITK	Q08881	620 aa		13.44	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	KLRB1	Q12918	225 aa		13.44	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	KRT81	Q14533	505 aa		13.44	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	IQCB1	Q15051	598 aa		13.44	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	AGER	Q15109	404 aa		13.44	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	DPYSL2	Q16555	572 aa		13.44	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	BOLA3	Q53S33	107 aa		13.44	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		13.44	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	BBS5	Q8N3I7	341 aa		13.44	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	PGBD5	Q8N414	524 aa		13.44	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		13.44	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	USP7	Q93009	1102 aa		13.44	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	NUS1	Q96E22	293 aa		13.44	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	ZNF599	Q96NL3	588 aa		13.44	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	13.44	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	NUP85	Q9BW27	656 aa		13.44	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	LGR4	Q9BXB1	951 aa		13.44	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		13.44	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		13.44	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	NOD2	Q9HC29	1040 aa		13.44	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	CBX8	Q9HC52	389 aa		13.44	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		13.44	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		13.44	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		13.44	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778		A0A1W2PQM1	296 aa		13.43	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	CFAP69	A5D8W1	941 aa		13.43	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778		K7EM74	188 aa		13.43	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	NR1D1	P20393	614 aa		13.43	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	KEL	P23276	732 aa		13.43	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	CCKBR	P32239	447 aa		13.43	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	MMP13	P45452	471 aa		13.43	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	KIAA1024L	P59773	190 aa		13.43	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	FANCC	Q00597	558 aa		13.43	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	PTPRR	Q15256	657 aa		13.43	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	MARC1	Q5VT66	337 aa		13.43	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	PNCK	Q6P2M8	343 aa		13.43	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	SFTPA2	Q8IWL1	248 aa		13.43	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	PELI3	Q8N2H9	469 aa		13.43	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		13.43	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		13.43	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	STRADB	Q9C0K7	418 aa		13.43	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		13.43	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		13.43	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		13.43	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778		A0A087X0T9	212 aa		13.42	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778		A0A0U1RQS6	177 aa		13.42	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	MAFK	O60675	156 aa		13.42	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	VPS4B	O75351	444 aa		13.42	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	SERPING1	P05155	500 aa		13.42	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	FAM228B	P0C875	321 aa		13.42	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	PRF1	P14222	555 aa		13.42	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	LIF	P15018	202 aa		13.42	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	CTPS1	P17812	591 aa		13.42	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	GM2A	P17900	193 aa		13.42	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	VIPR1	P32241	457 aa		13.42	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	SERPINB6	P35237	376 aa		13.42	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	ETV3	P41162	512 aa		13.42	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	ARSD	P51689	593 aa		13.42	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	CDH6	P55285	790 aa		13.42	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	UBASH3A	P57075	661 aa		13.42	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	TRAF2	Q12933	501 aa		13.42	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	MMRN1	Q13201	1228 aa		13.42	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	ARHGEF7	Q14155	803 aa		13.42	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	CNGA3	Q16281	694 aa		13.42	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		13.42	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		13.42	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	CCNJL	Q8IV13	435 aa		13.42	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	NKD1	Q969G9	470 aa		13.42	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	POM121	Q96HA1	1249 aa		13.42	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	COQ10A	Q96MF6	247 aa		13.42	□□□□□ -0.26
APBB1-208	ENST00000529778	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		13.42	□□□□□ -0.26

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