RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524131.5

MEG3-223, Transcript of maternally expressed 3, human

TSL 5 BASIC

Gene MEG3, Length 721 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEG3-223	ENST00000524131	CAMK2B	Q13554	666 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	GEN1	Q17RS7	908 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	MPPE1	Q53F39	396 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	FYB2	Q5VWT5	728 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	MPP5	Q8N3R9	675 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	BHMT	Q93088	406 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	CERS2	Q96G23	380 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	FEM1C	Q96JP0	617 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	PSKH2	Q96QS6	385 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	CPNE1	Q99829	537 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	MGME1	Q9BQP7	344 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	GAREM1	Q9H706	876 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	NT5M	Q9NPB1	228 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	SLCO1B1	Q9Y6L6	691 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	METTL12	A8MUP2	240 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131		J3KR12	359 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	BCAT2	O15382	392 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	FLRT2	O43155	660 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	FGF1	P05230	155 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	PAM	P19021	973 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	HLA-DPA1	P20036	260 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	ACVRL1	P37023	503 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	GP5	P40197	560 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	CCNF	P41002	786 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	POLD2	P49005	469 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	IL9R	Q01113	521 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	SLC12A1	Q13621	1099 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	SPARCL1	Q14515	664 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	STARD3	Q14849	445 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	11.69	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	HLA-B	Q31612	363 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	GRTP1	Q5TC63	336 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	IPMK	Q8NFU5	416 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	FICD	Q9BVA6	458 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	HEATR9	A2RTY3	570 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	NPC1	O15118	1278 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	TYROBP	O43914	113 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	SIN3B	O75182	1162 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	CYBB	P04839	570 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	C7	P10643	843 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	CA4	P22748	312 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	PLK1	P53350	603 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	DMTN	Q08495	405 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	11.68	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	ZNF234	Q14588	700 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	DBN1	Q16643	649 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	UGP2	Q16851	508 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	BANP	Q8N9N5	519 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MEG3-223	ENST00000524131	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		11.68	□□□□□ -0.54

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