RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 CRISPLD1Q9H336 500 aa7.86□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 GPAMQ9HCL2 828 aa7.86□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 FANCFQ9NPI8 374 aa7.86□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa7.86□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 ERVK-11Q9UQG0 969 aa7.86□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 CHKBQ9Y259 395 aa7.86□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 IFT52Q9Y366 437 aa7.86□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 GOLGA8OA6NCC3 632 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 OR5K4A6NMS3 321 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 GOLGA8NF8WBI6 632 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 C1RP00736 705 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 PRKCGP05129 697 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 GABRR2P28476 465 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 CRHR1P34998 444 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 HSD17B2P37059 387 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 MAGEA11P43364 429 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 NAGLUP54802 743 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 POTEHQ6S545 545 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 CD300LGQ6UXG3 332 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 OR6K2Q8NGY2 324 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 ARNTL2Q8WYA1 636 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 PHF21BQ96EK2 531 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 IGSF21Q96ID5 467 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 FCRL5Q96RD9 977 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 RBBP8Q99708 897 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 CAAP1Q9H8G2 361 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 SCUBE2Q9NQ36 999 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 SPG21Q9NZD8 308 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 SOX13Q9UN79 622 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 TRPM7Q96QT4 1865 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 A0A0D9SEW6 157 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 A8MX80 341 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 GPC4O75487 556 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 NDUFS3O75489 264 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 CIB2O75838 187 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 BPGMP07738 259 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 OCM2P0CE71 109 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 LIMK2P53671 638 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 RHOAP61586 193 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 FAM189BP81408 668 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 PPP2R2BQ00005 443 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 SEMA3BQ13214 749 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 RNF43Q68DV7 783 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 USP43Q70EL4 1123 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF461Q8TAF7 563 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 PRKD2Q9BZL6 878 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 SLC25A51Q9H1U9 297 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 SEPT3Q9UH03 358 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 ARHGAP10A1A4S6 786 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 B2RBV5 119 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 FCHO1O14526 889 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 STX7O15400 261 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC22O60826 627 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 ARHGEF15O94989 841 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 SERPINE1P05121 402 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 GJA1P17302 382 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 GNA12Q03113 381 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 SLC18A2Q05940 514 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 FAM83EQ2M2I3 478 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 MRNIPQ6NTE8 343 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 NIPAL1Q6NVV3 410 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 FAM122CQ6P4D5 195 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 HIPK4Q8NE63 616 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 GPR63Q9BZJ6 419 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 CASS4Q9NQ75 786 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 MARCH5Q9NX47 278 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 THEGQ9P2T0 379 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 KCNN3Q9UGI6 736 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 YIPF1Q9Y548 306 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 B8ZZF3 427 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 E5RI56 91 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 TK2O00142 265 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 KLHL41O60662 606 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 PLIN3O60664 434 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 TRIM13O60858 407 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 TBL1XO60907 577 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 GLP2RO95838 553 aa7.84□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms