RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519020.5

FAM49B-210, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, humanhuman

TSL 5

Gene FAM49B, Length 573 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM49B-210ENST00000519020 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa15.97■□□□□ 0.15
FAM49B-210ENST00000519020 ALG6Q9Y672 507 aa15.97■□□□□ 0.15
FAM49B-210ENST00000519020 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa15.96■□□□□ 0.15
FAM49B-210ENST00000519020 KCNK1O00180 336 aa15.96■□□□□ 0.15
FAM49B-210ENST00000519020 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
FAM49B-210ENST00000519020 MMP2P08253 660 aa15.96■□□□□ 0.15
FAM49B-210ENST00000519020 FECHP22830 423 aa15.96■□□□□ 0.15
FAM49B-210ENST00000519020 CDKN2BP42772 138 aa15.96■□□□□ 0.15
FAM49B-210ENST00000519020 GABREP78334 506 aa15.96■□□□□ 0.15
FAM49B-210ENST00000519020 SKOR1P84550 965 aa15.96■□□□□ 0.15
FAM49B-210ENST00000519020 ZBTB17Q13105 803 aa15.96■□□□□ 0.15
FAM49B-210ENST00000519020 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
FAM49B-210ENST00000519020 TEX44Q53QW1 395 aa15.96■□□□□ 0.15
FAM49B-210ENST00000519020 TFDP3Q5H9I0 405 aa15.96■□□□□ 0.15
FAM49B-210ENST00000519020 CERCAMQ5T4B2 595 aa15.96■□□□□ 0.15
FAM49B-210ENST00000519020 MFSD7Q6UXD7 560 aa15.96■□□□□ 0.15
FAM49B-210ENST00000519020 RCOR2Q8IZ40 523 aa15.96■□□□□ 0.15
FAM49B-210ENST00000519020 EXD1Q8NHP7 514 aa15.96■□□□□ 0.15
FAM49B-210ENST00000519020 CCDC74AQ96AQ1 378 aa15.96■□□□□ 0.15
FAM49B-210ENST00000519020 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
FAM49B-210ENST00000519020 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
FAM49B-210ENST00000519020 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
FAM49B-210ENST00000519020 HIC2Q96JB3 615 aa15.96■□□□□ 0.15
FAM49B-210ENST00000519020 VAT1Q99536 393 aa15.96■□□□□ 0.15
FAM49B-210ENST00000519020 DPEP2Q9H4A9 486 aa15.96■□□□□ 0.15
FAM49B-210ENST00000519020 THSD1Q9NS62 852 aa15.96■□□□□ 0.15
FAM49B-210ENST00000519020 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa15.96■□□□□ 0.15
FAM49B-210ENST00000519020 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 NOBOXO60393 691 aa15.95■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 SOD1P00441 154 aa15.95■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 ZNF75DP51815 510 aa15.95■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 LRP8Q14114 963 aa15.95■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 IHHQ14623 411 aa15.95■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 PPP2R5EQ16537 467 aa15.95■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 QPCTQ16769 361 aa15.95■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa15.95■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 CNTD1Q8N815 330 aa15.95■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 TMEM74Q96NL1 305 aa15.95■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 VPS18Q9P253 973 aa15.95■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 CD84Q9UIB8 345 aa15.95■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 SUFUQ9UMX1 484 aa15.95■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 CACNA1GO43497 2377 aa15.95■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 DSPP15924 2871 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 CCDC187A0A096LP49 1063 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 BTNL10A8MVZ5 291 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 HACD1B0YJ81 288 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 D6RAR5 112 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 CST8O60676 142 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 NDUFA10O95299 355 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 CLDN7O95471 211 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 TNNT1P13805 278 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 GNPDA1P46926 289 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 SPINT3P49223 89 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 DCDC1P59894 354 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 COPS2P61201 443 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 COL28A1Q2UY09 1125 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 KCTD16Q68DU8 428 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 CCDC70Q6NSX1 233 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 DAAM2Q86T65 1068 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 TXLNBQ8N3L3 684 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 ZNF248Q8NDW4 579 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 P3H4Q92791 437 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 TADA1Q96BN2 335 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 COX14Q96I36 57 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 DCBLD2Q96PD2 775 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 OR2M4Q96R27 311 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 STRADBQ9C0K7 418 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 LRRN3Q9H3W5 708 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 RMI1Q9H9A7 625 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 MAGEE1Q9HCI5 957 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 B4DGG1 531 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 MPOP05164 745 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 CCKBRP32239 447 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 ADCY8P40145 1251 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 DYNLT1P63172 113 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 CDK18Q07002 472 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 C3orf38Q5JPI3 329 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 PDPK2PQ6A1A2 396 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-210ENST00000519020 NPNTQ6UXI9 565 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms