RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511467.1

PTPN13-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 13, human

APPRIS P4 TSL 2 BASIC

Gene PTPN13, Length 8,076 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN13-209	ENST00000511467	JUND	P17535	347 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	HSD17B3	P37058	310 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	HNF4A	P41235	474 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	CACNB3	P54284	484 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	NFKB2	Q00653	900 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	MVK	Q03426	396 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	DGUOK	Q16854	277 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	TRIM16L	Q309B1	348 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	MPP7	Q5T2T1	576 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	CAPN13	Q6MZZ7	669 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	ADCK1	Q86TW2	530 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	ACTL9	Q8TC94	416 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	PMM1	Q92871	262 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	C2CD2L	O14523	706 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	AP2A1	O95782	977 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	IL6	P05231	212 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	NAT2	P11245	290 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	CASR	P41180	1078 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	GABRB2	P47870	512 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	ACOT2	P49753	483 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	CXCL9	Q07325	125 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	SPIDR	Q14159	915 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	LRRC70	Q7Z2Q7	622 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	ZNF276	Q8N554	614 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	S100A13	Q99584	98 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	SCML2	Q9UQR0	700 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	SNX24	Q9Y343	169 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	MICAL2	O94851	1124 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	UROS	P10746	265 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	CASP2	P42575	452 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	ADIG	Q0VDE8	80 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	SERINC3	Q13530	473 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	NFE2L1	Q14494	772 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	MELK	Q14680	651 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	SLC1A5	Q15758	541 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	DACH2	Q96NX9	599 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	SIK2	Q9H0K1	926 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	PLK2	Q9NYY3	685 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	TNFRSF10B	O14763	440 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	FSBP	O95073	299 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	FGB	P02675	491 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	THEGL	P0DJG4	465 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	FECH	P22830	423 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	CDC25A	P30304	524 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	TMBIM6	P55061	237 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	ANTXR2	P58335	489 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	NEPRO	Q6NW34	567 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	USP7	Q93009	1102 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	MYLPF	Q96A32	169 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	TMEM143	Q96AN5	459 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	CDCA5	Q96FF9	252 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	BMF	Q96LC9	184 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	C7orf26	Q96N11	449 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	ZNF358	Q9NW07	568 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	RAB26	Q9ULW5	256 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	HDAC3	O15379	428 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	TCF4	P15884	667 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	GPC1	P35052	558 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	ACTR1B	P42025	376 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	INCA1	Q0VD86	236 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	LRRC41	Q15345	812 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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