RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 CCDC28BQ9BUN5 200 aa12.77□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 UNC93B1Q9H1C4 597 aa12.77□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa12.77□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 VPS45Q9NRW7 570 aa12.77□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 GALPQ9UBC7 116 aa12.77□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 TBC1D4O60343 1298 aa12.77□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 NIPSNAP2O75323 286 aa12.77□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 ALDH1A2O94788 518 aa12.77□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 HALP42357 657 aa12.77□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 PPP3CCP48454 512 aa12.77□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 CREB5Q02930 508 aa12.77□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 CLCQ05315 142 aa12.77□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 GPR107Q5VW38 600 aa12.77□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 CES4AQ5XG92 561 aa12.77□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 CAMK1DQ8IU85 385 aa12.77□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 TTC9BQ8N6N2 239 aa12.77□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 ADCY4Q8NFM4 1077 aa12.77□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 ITFG1Q8TB96 612 aa12.77□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC2A13Q96QE2 648 aa12.77□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 OLFM1Q99784 485 aa12.77□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 KIFC1Q9BW19 673 aa12.77□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 SPATA16Q9BXB7 569 aa12.77□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 ZBTB26Q9HCK0 441 aa12.77□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 FKBPLQ9UIM3 349 aa12.77□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 ESRRBO95718 433 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 GSNP06396 782 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 OCA2Q04671 838 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 ACAP2Q15057 778 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 SPATA17Q96L03 361 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 ANAPC2Q9UJX6 822 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 GABRQQ9UN88 632 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 ITGALP20701 1170 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 LPOP22079 712 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 MOSPD1Q9UJG1 213 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 A0A0D9SEW6 157 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 CDC7O00311 574 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 HS6ST1O60243 411 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 LSM3P62310 102 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 NADK2Q4G0N4 442 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 CACHD1Q5VU97 1274 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 SPESP1Q6UW49 350 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 ELOVL6Q9H5J4 265 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 DNAJB4Q9UDY4 337 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 A0A1W2PQ67 120 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 PPP6CO00743 305 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 C1RP00736 705 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 NTRK1P04629 796 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 FGF1P05230 155 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 TACR2P21452 398 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 KCNA5P22460 613 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 YAP1P46937 504 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 NR1H2P55055 460 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 BFSP2Q13515 415 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM219BQ5XKK7 198 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 UGT3A1Q6NUS8 523 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF276Q8N554 614 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 MRGPRX2Q96LB1 330 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 HAPLN3Q96S86 360 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 NRXN2Q9P2S2 1712 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 SDHDO14521 159 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 MAFKO60675 156 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 RPP40O75818 363 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 FYNP06241 537 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 HLA-DPA1P20036 260 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 PRKG2Q13237 762 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 TLR1Q15399 786 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 MAVSQ7Z434 540 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 SAPCD2Q86UD0 394 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 IFNL1Q8IU54 200 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 GALNT15Q8N3T1 639 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 TTC30BQ8N4P2 665 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 ANKRD49Q8WVL7 239 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 IRGQQ8WZA9 623 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 BDH2Q9BUT1 245 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 OSBPL2Q9H1P3 480 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-211ENST00000503687 POLG2Q9UHN1 485 aa12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms