RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498268.1

USP34-222, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 3

Gene USP34, Length 497 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-222	ENST00000498268	REEP2	Q9BRK0	252 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	FKRP	Q9H9S5	495 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	HINT3	Q9NQE9	182 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	PADI3	Q9ULW8	664 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268		A0A087X002	238 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	TEX22	C9J3V5	150 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	HHLA1	C9JL84	531 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	PCDH7	O60245	1069 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	FTCD	O95954	541 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	IGHV4-39	P01824	125 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	GALT	P07902	379 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	ERVK-10	P10266	1014 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	NOV	P48745	357 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	MMP14	P50281	582 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	EFNB1	P98172	346 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	RUNX1T1	Q06455	604 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	ZNF234	Q14588	700 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	ANKRD1	Q15327	319 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	TCTN1	Q2MV58	587 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	SUSD1	Q6UWL2	747 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	STPG4	Q8N801	248 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	OR52I2	Q8NH67	350 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	PIGT	Q969N2	578 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	LRR1	Q96L50	414 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	CDK19	Q9BWU1	502 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	ZNHIT1	O43257	154 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	PLIN1	O60240	522 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	PRSS56	P0CW18	603 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	GNB3	P16520	340 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	RRM1	P23921	792 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	RAD23B	P54727	409 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	DSCR10	P59022	87 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	SORD	Q00796	357 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	BEST3	Q8N1M1	668 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	TM9SF4	Q92544	642 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	LINGO1	Q96FE5	620 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	SYNGR3	O43761	229 aa		3.34	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	PRKN	O60260	465 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	CIDEA	O60543	219 aa		3.34	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	CTSV	O60911	334 aa		3.34	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	TF	P02787	698 aa		3.34	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	TMEM187	Q14656	261 aa		3.34	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	PPP2R5B	Q15173	497 aa		3.34	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		3.34	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		3.34	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	TXNDC8	Q6A555	127 aa		3.34	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		3.34	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	USP38	Q8NB14	1042 aa		3.34	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		3.34	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		3.34	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	SH3GL2	Q99962	352 aa		3.34	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	TMEM160	Q9NX00	188 aa		3.34	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	PAK5	Q9P286	719 aa		3.34	□□□□□ -1.87
USP34-222	ENST00000498268	C5orf60	A6NFR6	353 aa		3.33	□□□□□ -1.88
USP34-222	ENST00000498268	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
USP34-222	ENST00000498268	POU1F1	P28069	291 aa		3.33	□□□□□ -1.88
USP34-222	ENST00000498268	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
USP34-222	ENST00000498268	TERF1	P54274	439 aa		3.33	□□□□□ -1.88
USP34-222	ENST00000498268	NAE1	Q13564	534 aa		3.33	□□□□□ -1.88

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.3 ms