RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	TAZ	Q16635	292 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	DOK6	Q6PKX4	331 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	GATA6	Q92908	595 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	VOPP1	Q96AW1	172 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	ZSCAN5A	Q9BUG6	496 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	BOC	Q9BWV1	1114 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	CEP41	Q9BYV8	373 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	STRADB	Q9C0K7	418 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	RMI1	Q9H9A7	625 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	KLF15	Q9UIH9	416 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	PKP3	Q9Y446	797 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM149A	A5PLN7	773 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	TRABD2B	A6NFA1	517 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	OPA1	O60313	960 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	GCAT	O75600	419 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	EPO	P01588	193 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC175	P0C221	793 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	HLA-DPA1	P20036	260 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	LHCGR	P22888	699 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	PTPN7	P35236	360 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	SPINT3	P49223	89 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	PDE1B	Q01064	536 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	PTS	Q03393	145 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	GTF2H3	Q13889	308 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	LRP8	Q14114	963 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	TCEA2	Q15560	299 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	QPCT	Q16769	361 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	AVL9	Q8NBF6	648 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	KRT35	Q92764	455 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	PDXP	Q96GD0	296 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	TTC25	Q96NG3	672 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	FCRL5	Q96RD9	977 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	ABCG8	Q9H221	673 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	TFR2	Q9UP52	801 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM202	A6NGA9	273 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246		B4DGG1	531 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	KCNN4	O15554	427 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	PPFIA2	O75334	1257 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	GAS8	O95995	478 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	FGF1	P05230	155 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	IVL	P07476	585 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	GPR89B	P0CG08	455 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	RBP3	P10745	1247 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	GLB1	P16278	677 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	VCL	P18206	1134 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	NFKB1	P19838	968 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	RBMS1	P29558	406 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	NOMO1	Q15155	1222 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	CNTD1	Q8N815	330 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	IPMK	Q8NFU5	416 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	GDAP1	Q8TB36	358 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	ACTL9	Q8TC94	416 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	OR2M4	Q96R27	311 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC3	Q9BQI4	270 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	DESI2	Q9BSY9	194 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	FGF22	Q9HCT0	170 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	VPS18	Q9P253	973 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	SUFU	Q9UMX1	484 aa		11.28	□□□□□ -0.6

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