RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 MEAF6Q9HAF1 191 aa12.84□□□□□ -0.35
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PRAME-213ENST00000492657 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
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PRAME-213ENST00000492657 HOXD10P28358 340 aa12.83□□□□□ -0.36
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PRAME-213ENST00000492657 GALNT7Q86SF2 657 aa12.83□□□□□ -0.36
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PRAME-213ENST00000492657 CRIPAKQ8N1N5 446 aa12.83□□□□□ -0.36
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PRAME-213ENST00000492657 CENPKQ9BS16 269 aa12.83□□□□□ -0.36
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PRAME-213ENST00000492657 SMPD4Q9NXE4 827 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 PCDH10Q9P2E7 1040 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 HSFX1Q9UBD0 423 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 ANKRD36A6QL64 1941 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 A0A1B0GTW7 788 aa12.83□□□□□ -0.36
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PRAME-213ENST00000492657 SLC22A2O15244 555 aa12.83□□□□□ -0.36
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PRAME-213ENST00000492657 EPOP01588 193 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 MTHFD2P13995 350 aa12.83□□□□□ -0.36
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PRAME-213ENST00000492657 STC1P52823 247 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 NOGQ13253 232 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
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PRAME-213ENST00000492657 C5orf22Q49AR2 442 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 SLC22A9Q8IVM8 553 aa12.83□□□□□ -0.36
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PRAME-213ENST00000492657 TTC16Q8NEE8 873 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 SEPT8Q92599 483 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 SLC45A3Q96JT2 553 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 TTLL2Q9BWV7 592 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 BPIFA1Q9NP55 256 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
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PRAME-213ENST00000492657 SEPT3Q9UH03 358 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 APPL1Q9UKG1 709 aa12.83□□□□□ -0.36
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PRAME-213ENST00000492657 STC2O76061 302 aa12.82□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
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PRAME-213ENST00000492657 DEFB128Q7Z7B8 93 aa12.82□□□□□ -0.36
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PRAME-213ENST00000492657 LPCAT1Q8NF37 534 aa12.82□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 GPR150Q8NGU9 434 aa12.82□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 CAPNS2Q96L46 248 aa12.82□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 PSKH2Q96QS6 385 aa12.82□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 SERPINI1Q99574 410 aa12.82□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 SLC30A3Q99726 388 aa12.82□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 VCX3AQ9NNX9 186 aa12.82□□□□□ -0.36
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PRAME-213ENST00000492657 PHF24Q9UPV7 400 aa12.82□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 C9JVG2 144 aa12.82□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 E7ENX8 843 aa12.82□□□□□ -0.36
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PRAME-213ENST00000492657 GPR39O43194 453 aa12.82□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 KDELR3O43731 214 aa12.82□□□□□ -0.36
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PRAME-213ENST00000492657 RHOBTB1O94844 696 aa12.82□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 CDK14O94921 469 aa12.82□□□□□ -0.36
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PRAME-213ENST00000492657 BMP1P13497 986 aa12.82□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 ALDH1A3P47895 512 aa12.82□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 CDH4P55283 916 aa12.82□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 FOLH1Q04609 750 aa12.82□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 BFSP2Q13515 415 aa12.82□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 PDK3Q15120 406 aa12.82□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 UGT3A2Q3SY77 523 aa12.82□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 HECTD3Q5T447 861 aa12.82□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP12.82□□□□□ -0.369e-8■□□□□ 10.7
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