RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491292.5

ERCC3-208, Transcript of ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunit, human

TSL 2

Gene ERCC3, Length 4,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERCC3-208	ENST00000491292	EFHB	Q8N7U6	833 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	AFG1L	Q8WV93	481 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	TMBIM1	Q969X1	311 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	ACD	Q96AP0	544 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	C3orf30	Q96M34	536 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	SCN3B	Q9NY72	215 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	PFDN6	O15212	129 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	MAGEA3	P43357	314 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	POU4F1	Q01851	419 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	PTPRCAP	Q14761	206 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	SYT16	Q17RD7	645 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	CALML6	Q8TD86	181 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	MAGED4	Q96JG8	741 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	EGFL8	Q99944	293 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	GBA3	Q9H227	469 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	RUBCNL	Q9H714	662 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	PDE10A	Q9Y233	779 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292		A0A087X1B8	175 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292		G3V2T6	193 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM20B	O75063	409 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	GSN	P06396	782 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	ITGB6	P18564	788 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	FMO4	P31512	558 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	CD86	P42081	329 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	ARHGDIA	P52565	204 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	BNIP2	Q12982	314 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	GRM1	Q13255	1194 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	LRP8	Q14114	963 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	AKAP14	Q86UN6	197 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	BBS2	Q9BXC9	721 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	SIAE	Q9HAT2	523 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	CNTNAP1	P78357	1384 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	TMEM221	A6NGB7	291 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292		E5RI56	91 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	9.8	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	TOMM70	O94826	608 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	INMT	O95050	263 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM163B	P0C2L3	166 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF24	P17028	368 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	CAPN3	P20807	821 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	HK2	P52789	917 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	ENPEP	Q07075	957 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	COLEC12	Q5KU26	742 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	PRMT9	Q6P2P2	845 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	STRADA	Q7RTN6	431 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	TMEM135	Q86UB9	458 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	MCFD2	Q8NI22	146 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	BIRC7	Q96CA5	298 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	NODAL	Q96S42	347 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	FZD8	Q9H461	694 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	BTN3A1	O00481	513 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	NPHS1	O60500	1241 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	NDUFS3	O75489	264 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	9.8	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	GUCA1C	O95843	209 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC2A4	P14672	509 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	CYP2B6	P20813	491 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	DGKQ	P52824	942 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	WNT3A	P56704	352 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	UFM1	P61960	85 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	TTC23	Q5W5X9	447 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	LZTR1	Q8N653	840 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	NPW	Q8N729	165 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF560	Q96MR9	790 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	CDK15	Q96Q40	435 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	COMMD8	Q9NX08	183 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	DPYSL4	O14531	572 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ERCC3-208	ENST00000491292	FFAR3	O14843	346 aa		9.8	□□□□□ -0.84

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