RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CNBD2Q96M20 576 aa15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRGUKQ96M69 825 aa15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PCDHAC1Q9H158 963 aa15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLEC4EQ9ULY5 219 aa15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 YIPF1Q9Y548 306 aa15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GMEB1Q9Y692 573 aa15.51■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MYO15AQ9UKN7 3530 aa15.5■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PLXNA3P51805 1871 aa15.5■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VCANP13611 3396 aa15.5■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PITPNM1O00562 1244 aa15.5■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LSM1O15116 133 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VARSP26640 1264 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KCNC1P48547 511 aa15.5■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDKN2DP55273 166 aa15.5■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDH13P55290 713 aa15.5■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GNA12Q03113 381 aa15.5■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GK3PQ14409 553 aa15.5■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HECTD3Q5T447 861 aa15.5■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HS6ST3Q8IZP7 471 aa15.5■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TREX1Q9NSU2 369 aa15.5■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MID2Q9UJV3 735 aa15.5■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 APPL1Q9UKG1 709 aa15.5■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRANK1O15050 2925 aa15.5■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FOLH1Q04609 750 aa15.5■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IKBKEQ14164 716 aa15.5■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPR158Q5T848 1215 aa15.5■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BEND5Q7L4P6 421 aa15.5■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF554Q86TJ5 538 aa15.5■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PAF1Q8N7H5 531 aa15.5■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa15.5■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 JADE3Q92613 823 aa15.5■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HSPBAP1Q96EW2 488 aa15.5■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC45A3Q96JT2 553 aa15.5■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IL1RL2Q9HB29 575 aa15.5■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IL37Q9NZH6 218 aa15.5■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM50BQ9Y247 325 aa15.5■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM92AA1XBS5 289 aa15.49■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UQCRBP14927 111 aa15.49■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATP6V1B1P15313 513 aa15.49■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UGP2Q16851 508 aa15.49■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAP7D1Q3KQU3 841 aa15.49■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PITRM1Q5JRX3 1037 aa15.49■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM207Q6UWW9 146 aa15.49■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C16orf89Q6UX73 402 aa15.49■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CYP2R1Q6VVX0 501 aa15.49■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa15.49■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KBTBD6Q86V97 674 aa15.49■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LPCAT1Q8NF37 534 aa15.49■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR9I1Q8NGQ6 314 aa15.49■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC39A3Q9BRY0 314 aa15.49■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ABCG8Q9H221 673 aa15.49■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ALG9Q9H6U8 611 aa15.49■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MTRRQ9UBK8 725 aa15.49■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GIMAP2Q9UG22 337 aa15.49■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRAMEF12O95522 483 aa15.49■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 APOA4P06727 396 aa15.49■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CTPS1P17812 591 aa15.49■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PDK3Q15120 406 aa15.49■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IYDQ6PHW0 289 aa15.49■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PQLC1Q8N2U9 271 aa15.49■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NCSTNQ92542 709 aa15.49■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPR78Q96P69 363 aa15.49■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SERPINI1Q99574 410 aa15.49■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa15.49■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa15.49■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa15.48■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 H7C4K7 107 aa15.48■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPP6CO00743 305 aa15.48■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SUPT7LO94864 414 aa15.48■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NELFEP18615 380 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NDST2P52849 883 aa15.48■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AGKQ53H12 422 aa15.48■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRRC73Q5JTD7 316 aa15.48■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KDM1BQ8NB78 822 aa15.48■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DCUN1D1Q96GG9 259 aa15.48■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP15.48■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STK39Q9UEW8 545 aa15.48■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa15.48■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC162PA2VCL2 907 aa15.48■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LDB2O43679 373 aa15.48■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DNAJA2O60884 412 aa15.48■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TBL1XO60907 577 aa15.48■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPC4O75487 556 aa15.48■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GOT2P00505 430 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms