RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 SLC6A18Q96N87 628 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 PLIN2Q99541 437 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 GDF15Q99988 308 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 APOL4Q9BPW4 351 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 C17orf62Q9BQA9 187 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 IDI2Q9BXS1 227 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 CALN1Q9BXU9 219 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 ARMT1Q9H993 441 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 ANLNQ9NQW6 1124 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 ACOXLQ9NUZ1 547 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 FAM86C1Q9NVL1 165 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 SMOXQ9NWM0 555 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 ZNF229Q9UJW7 825 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 MKLN1Q9UL63 735 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 A0A1W2PQ67 120 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 LINC00862A6NCI5 91 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 HMX3A6NHT5 357 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 PDZK1P1A8MUH7 402 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 H3BMM5 538 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 CCRL2O00421 344 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 NCAM2O15394 837 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 RASAL1O95294 804 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 SLC4A1P02730 911 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 CAPN1P07384 714 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 STMN1P16949 149 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 SMPD1P17405 629 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 CYP3A5P20815 502 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 LPOP22079 712 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 IL10P22301 178 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 PRKAR1BP31321 381 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 ETV6P41212 452 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 SLC12A3P55017 1021 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 MFAP3P55082 362 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
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PKP4-211ENST00000481115 MYL7Q01449 175 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 MVKQ03426 396 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 TAP1Q03518 808 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 PRKCDQ05655 676 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 SMARCB1Q12824 385 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 GPS1Q13098 491 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 PIK3R6Q5UE93 754 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 SHEQ5VZ18 495 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 FAM205BPQ63HN1 556 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 MBLAC2Q68D91 279 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 RINT1Q6NUQ1 792 aa7.16□□□□□ -1.26
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PKP4-211ENST00000481115 BEND5Q7L4P6 421 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 OTOP3Q7RTS5 596 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 POLNQ7Z5Q5 900 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 LDHDQ86WU2 507 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 LYSMD2Q8IV50 215 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 LCORLQ8N3X6 602 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 CCDC185Q8N715 623 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 SLC35B2Q8TB61 432 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 URGCPQ8TCY9 931 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 TBCKQ8TEA7 893 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 ANKRD49Q8WVL7 239 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 SHC3Q92529 594 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 PIK3R3Q92569 461 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 SGCDQ92629 289 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 FAM149B1Q96BN6 582 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 SERAC1Q96JX3 654 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 TMEM246Q9BRR3 403 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 CHID1Q9BWS9 393 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 NIPAL2Q9H841 368 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 WDR41Q9HAD4 459 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 HPS4Q9NQG7 708 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 GIMAP4Q9NUV9 329 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 DCAF16Q9NXF7 216 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 TAS2R14Q9NYV8 317 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 GGA3Q9NZ52 723 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 DTLQ9NZJ0 730 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 PI4KBQ9UBF8 816 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 FBXO5Q9UKT4 447 aa7.16□□□□□ -1.26
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