RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472230.5

GCFC2-208, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, human

TSL 2

Gene GCFC2, Length 2,265 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCFC2-208	ENST00000472230	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		18.26	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	FCHO1	O14526	889 aa		18.25	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	18.25	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	PYGL	P06737	847 aa		18.25	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	RASSF2	P50749	326 aa		18.25	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	DHCR24	Q15392	516 aa		18.25	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		18.25	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		18.25	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	PIANP	Q8IYJ0	282 aa		18.25	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	STK40	Q8N2I9	435 aa		18.25	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		18.25	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	TTC1	Q99614	292 aa		18.25	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	CDH19	Q9H159	772 aa		18.25	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		18.25	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		18.25	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		18.25	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		18.25	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		18.25	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	ADH5	P11766	374 aa		18.25	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	WEE1	P30291	646 aa		18.25	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	XIAP	P98170	497 aa		18.25	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		18.25	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	USP45	Q70EL2	814 aa		18.25	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	18.25	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		18.25	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		18.25	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	FAM136A	Q96C01	138 aa		18.25	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		18.25	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	ALG9	Q9H6U8	611 aa		18.25	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		18.25	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	MSRA	Q9UJ68	235 aa		18.25	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	HAO1	Q9UJM8	370 aa		18.25	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	APPL1	Q9UKG1	709 aa		18.25	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	FAM50B	Q9Y247	325 aa		18.25	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	VPS26A	O75436	327 aa		18.24	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	CLDN7	O95471	211 aa		18.24	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	ADH1C	P00326	375 aa		18.24	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	18.24	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	PTGER3	P43115	390 aa		18.24	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	DNAJB13	P59910	316 aa		18.24	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		18.24	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		18.24	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230		Q6ZVU0	165 aa		18.24	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		18.24	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	18.24	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		18.24	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		18.24	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230		A0A1W2PQ67	120 aa		18.24	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	NPHS1	O60500	1241 aa		18.24	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	SMIM24	O75264	130 aa		18.24	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	CYP17A1	P05093	508 aa		18.24	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	18.24	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	FSHR	P23945	695 aa		18.24	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	PRKAA1	Q13131	559 aa		18.24	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		18.24	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		18.24	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	PIWIL4	Q7Z3Z4	852 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	18.24	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		18.24	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	AGR3	Q8TD06	166 aa		18.24	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	EID2B	Q96D98	161 aa		18.24	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	ASIC4	Q96FT7	647 aa		18.24	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	EBF4	Q9BQW3	602 aa		18.24	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		18.24	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	ACSS2	Q9NR19	701 aa		18.24	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		18.24	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230		A8MX80	341 aa		18.23	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230		E5RI56	91 aa		18.23	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	UGT2B4	P06133	528 aa		18.23	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	CHRNG	P07510	517 aa		18.23	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	CD1D	P15813	335 aa		18.23	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	ITGAL	P20701	1170 aa		18.23	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	VIPR2	P41587	438 aa		18.23	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	DGKG	P49619	791 aa		18.23	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	HK2	P52789	917 aa		18.23	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	18.23	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		18.23	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		18.23	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		18.23	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		18.23	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	PBX4	Q9BYU1	374 aa		18.23	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	CIPC	Q9C0C6	399 aa		18.23	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		18.23	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	IGFLR1	Q9H665	355 aa		18.23	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		18.23	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		18.23	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	TRIM24	O15164	1050 aa		18.23	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	ZBTB14	O43829	449 aa		18.23	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	DIAPH2	O60879	1101 aa		18.23	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51

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