RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463369.5

SHQ1-203, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SHQ1, Length 2,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-203ENST00000463369 TMEM40Q8WWA1 233 aa8.71□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 KIAA1191Q96A73 305 aa8.71□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 SLCO4A1Q96BD0 722 aa8.71□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 KLHL25Q9H0H3 589 aa8.71□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 NANOGQ9H9S0 305 aa8.71□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa8.71□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 GPRC5BQ9NZH0 403 aa8.71□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 POU2F3Q9UKI9 436 aa8.71□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 CNTN6Q9UQ52 1028 aa8.71□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 GINS2Q9Y248 185 aa8.71□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 SNX13Q9Y5W8 968 aa8.71□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 ANKRD34BA5PLL1 514 aa8.7□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 TSPAN1O60635 241 aa8.7□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 NOL3O60936 208 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 TADA2AO75478 443 aa8.7□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 CLPXO76031 633 aa8.7□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 BCL10O95999 233 aa8.7□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 GNAO1P09471 354 aa8.7□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 ALOX5P09917 674 aa8.7□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 AXLP30530 894 aa8.7□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 SLC7A1P30825 629 aa8.7□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 THPOP40225 353 aa8.7□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 TMBIM6P55061 237 aa8.7□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 CUL2Q13617 745 aa8.7□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 HERC3Q15034 1050 aa8.7□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 ZNF618Q5T7W0 954 aa8.7□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 HMBOX1Q6NT76 420 aa8.7□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 CHSY3Q70JA7 882 aa8.7□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 CYS1Q717R9 158 aa8.7□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 HERC6Q8IVU3 1022 aa8.7□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 GPD1LQ8N335 351 aa8.7□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa8.7□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 ANKFN1Q8N957 763 aa8.7□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 MFSD2AQ8NA29 543 aa8.7□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 FAM156AQ8NDB6 213 aa8.7□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 ZNF606Q8WXB4 792 aa8.7□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 TOP1MTQ969P6 601 aa8.7□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 FAM84AQ96KN4 292 aa8.7□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 SIGLEC10Q96LC7 697 aa8.7□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 ZNF347Q96SE7 839 aa8.7□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 TUBA1CQ9BQE3 449 aa8.7□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 ADPGKQ9BRR6 497 aa8.7□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 PAK5Q9P286 719 aa8.7□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 ANKMY1Q9P2S6 941 aa8.7□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 DKK3Q9UBP4 350 aa8.7□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 SOCS2O14508 198 aa8.69□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 EXTL3O43909 919 aa8.69□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 MYO1DO94832 1006 aa8.69□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 VAPBO95292 243 aa8.69□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 HLA-DRAP01903 254 aa8.69□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 CYP17A1P05093 508 aa8.69□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 POLBP06746 335 aa8.69□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 CKBP12277 381 aa8.69□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 BMP2P12643 396 aa8.69□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 CKMT2P17540 419 aa8.69□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 MAGEA6P43360 314 aa8.69□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 PSMD8P48556 350 aa8.69□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 NME5P56597 212 aa8.69□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 RAC1P63000 192 aa8.69□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 PRKCQQ04759 706 aa8.69□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 SELENBP1Q13228 472 aa8.69□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 NME3Q13232 169 aa8.69□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 HADHQ16836 314 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 INAVAQ3KP66 663 aa8.69□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 MPZL3Q6UWV2 235 aa8.69□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa8.69□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 KCTD8Q6ZWB6 473 aa8.69□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa8.69□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 ITIH5Q86UX2 942 aa8.69□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 NLRP8Q86W28 1048 aa8.69□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 KCTD6Q8NC69 237 aa8.69□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 CPB2Q96IY4 423 aa8.69□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 TOX2Q96NM4 488 aa8.69□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 MSTO1Q9BUK6 570 aa8.69□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 OSBPL10Q9BXB5 764 aa8.69□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 ZNF385DQ9H6B1 395 aa8.69□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 SMOXQ9NWM0 555 aa8.69□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 MOCS1Q9NZB8 636 aa8.69□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 TMEM216Q9P0N5 145 aa8.69□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 POLHQ9Y253 713 aa8.69□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 TRAF6Q9Y4K3 522 aa8.69□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms