RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 ALG3Q92685 438 aa23.9■■□□□ 1.42
SMKR1-201ENST00000462322 TADA1Q96BN2 335 aa23.9■■□□□ 1.42
SMKR1-201ENST00000462322 HERPUD2Q9BSE4 406 aa23.9■■□□□ 1.42
SMKR1-201ENST00000462322 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
SMKR1-201ENST00000462322 ABCG4Q9H172 646 aa23.9■■□□□ 1.42
SMKR1-201ENST00000462322 SIRPGQ9P1W8 387 aa23.9■■□□□ 1.42
SMKR1-201ENST00000462322 GULP1Q9UBP9 304 aa23.9■■□□□ 1.42
SMKR1-201ENST00000462322 GPR34Q9UPC5 381 aa23.9■■□□□ 1.42
SMKR1-201ENST00000462322 TRABD2BA6NFA1 517 aa23.89■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 OPA1O60313 960 aa23.89■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 NFKB1P19838 968 aa23.89■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 CD68P34810 354 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 PTPN7P35236 360 aa23.89■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP23.89■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 XRCC4Q13426 336 aa23.89■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 CAMK2BQ13554 666 aa23.89■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 NOMO1Q15155 1222 aa23.89■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 CCDC70Q6NSX1 233 aa23.89■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa23.89■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 PID1Q7Z2X4 250 aa23.89■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 TAF8Q7Z7C8 310 aa23.89■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 NLRP8Q86W28 1048 aa23.89■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 VAT1Q99536 393 aa23.89■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM168Q9H0V1 697 aa23.89■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 UBP1Q9NZI7 540 aa23.89■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa23.89■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 SOD1P00441 154 aa23.88■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 CEACAM5P06731 702 aa23.88■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 PYGLP06737 847 aa23.88■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 PYGMP11217 842 aa23.88■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa23.88■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF567Q8N184 647 aa23.88■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 UBL4BQ8N7F7 174 aa23.88■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 ARL10Q8N8L6 244 aa23.88■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 ACTL9Q8TC94 416 aa23.88■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 MAPK15Q8TD08 544 aa23.88■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 AGAP2Q99490 1192 aa23.88■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 PKD2L2Q9NZM6 624 aa23.88■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 FAM153AQ9UHL3 310 aa23.88■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 PADI4Q9UM07 663 aa23.88■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 CLCA2Q9UQC9 943 aa23.88■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 ASXL3Q9C0F0 2248 aa23.88■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 NDST3O95803 873 aa23.87■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 FTCDO95954 541 aa23.87■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 MT-CO3P00414 261 aa23.87■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 PIRTP0C851 137 aa23.87■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 SPINT3P49223 89 aa23.87■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 AADACL2Q6P093 401 aa23.87■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 DOK6Q6PKX4 331 aa23.87■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 KYQ8NBH2 561 aa23.87■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 NAT6Q93015 286 aa23.87■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 FAM83DQ9H4H8 585 aa23.87■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 C10orf88Q9H8K7 445 aa23.87■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa23.87■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 MAGEE1Q9HCI5 957 aa23.87■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 TRHDEQ9UKU6 1024 aa23.87■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 ASPMQ8IZT6 3477 aa23.87■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 F5H423 210 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 TJP3O95049 919 aa23.86■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 PTMAP06454 111 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 RBL1P28749 1068 aa23.86■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 GNPDA1P46926 289 aa23.86■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 POLD2P49005 469 aa23.86■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa23.86■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa23.86■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 FAM46DQ8NEK8 389 aa23.86■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 MDM1Q8TC05 714 aa23.86■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 HIC2Q96JB3 615 aa23.86■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 FCRL5Q96RD9 977 aa23.86■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 FERMT1Q9BQL6 677 aa23.86■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 SUFUQ9UMX1 484 aa23.86■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 SHOC2Q9UQ13 582 aa23.86■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa23.86■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 ADGRG1Q9Y653 693 aa23.86■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 RGSL1A5PLK6 1076 aa23.85■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 INPP4BO15327 924 aa23.85■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 SLC4A1P02730 911 aa23.85■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 FUCA1P04066 466 aa23.85■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 WNT3AP56704 352 aa23.85■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 PERM1Q5SV97 790 aa23.85■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 TRIM74Q86UV6 250 aa23.85■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 CCL4L1Q8NHW4 92 aa23.85■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 WDR24Q96S15 920 aa23.85■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 FAM118BQ9BPY3 351 aa23.85■■□□□ 1.41
SMKR1-201ENST00000462322 GPR63Q9BZJ6 419 aa23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.8 ms