RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 TEX44Q53QW1 395 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXB3-202ENST00000460160 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXB3-202ENST00000460160 NLRP8Q86W28 1048 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXB3-202ENST00000460160 CCDC50Q8IVM0 306 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXB3-202ENST00000460160 CCL4L1Q8NHW4 92 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXB3-202ENST00000460160 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
HOXB3-202ENST00000460160 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
HOXB3-202ENST00000460160 TADA1Q96BN2 335 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXB3-202ENST00000460160 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
HOXB3-202ENST00000460160 ADGRE3Q9BY15 652 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXB3-202ENST00000460160 RAXQ9Y2V3 346 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXB3-202ENST00000460160 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXB3-202ENST00000460160 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-202ENST00000460160 CASC3O15234 703 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-202ENST00000460160 GALNT3Q14435 633 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-202ENST00000460160 PPP2R5EQ16537 467 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-202ENST00000460160 TAF8Q7Z7C8 310 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-202ENST00000460160 NRSN1Q8IZ57 195 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-202ENST00000460160 P3H4Q92791 437 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-202ENST00000460160 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-202ENST00000460160 DEPDC7Q96QD5 511 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-202ENST00000460160 AGAP2Q99490 1192 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-202ENST00000460160 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-202ENST00000460160 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-202ENST00000460160 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-202ENST00000460160 GLOD4Q9HC38 313 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-202ENST00000460160 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-202ENST00000460160 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-202ENST00000460160 VAV2P52735 878 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-202ENST00000460160 WASHC5Q12768 1159 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-202ENST00000460160 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-202ENST00000460160 SPATA22Q8NHS9 363 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-202ENST00000460160 HAUS1Q96CS2 278 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-202ENST00000460160 TEKT5Q96M29 485 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-202ENST00000460160 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-202ENST00000460160 SUFUQ9UMX1 484 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-202ENST00000460160 PJA2O43164 708 aa23.58■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 CSO75390 466 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 CDC25BP30305 580 aa23.58■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 POLD2P49005 469 aa23.58■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 SLC14A2Q15849 920 aa23.58■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 BBS12Q6ZW61 710 aa23.58■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 KDELC2Q7Z4H8 507 aa23.58■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 SFTPA2Q8IWL1 248 aa23.58■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 FAM46DQ8NEK8 389 aa23.58■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 GPR156Q8NFN8 814 aa23.58■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 GPBAR1Q8TDU6 330 aa23.58■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 WDR24Q96S15 920 aa23.58■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 CCDC3Q9BQI4 270 aa23.58■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 HEMGNQ9BXL5 484 aa23.58■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa23.58■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 AK5Q9Y6K8 562 aa23.58■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 CD68P34810 354 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 PCSK7Q16549 785 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 OGFOD3Q6PK18 319 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 DOK6Q6PKX4 331 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 TRIM74Q86UV6 250 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 NRROSQ86YC3 692 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 LRRC57Q8N9N7 239 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 HERPUD2Q9BSE4 406 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 RABGEF1Q9UJ41 708 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 BPTFQ12830 3046 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 LOC400499M0QZD8 3231 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 NOBOXO60393 691 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 PYGLP06737 847 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 GNPDA1P46926 289 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 SPINT3P49223 89 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 CDK18Q07002 472 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 SPC24Q8NBT2 197 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 CCDC74AQ96AQ1 378 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 EID2BQ96D98 161 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 COX14Q96I36 57 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 HIC2Q96JB3 615 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP23.56■■□□□ 1.365e-6■■■■□ 24.8
HOXB3-202ENST00000460160 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 IMPACTQ9P2X3 320 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 IGSF10Q6WRI0 2623 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 SCN8AQ9UQD0 1980 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 GRID2IPA4D2P6 1211 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 MTSS1O43312 755 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 TCEA3O75764 348 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 IVLP07476 585 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 PIRTP0C851 137 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 CTNNA2P26232 953 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 COPS2P61201 443 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 ISXQ2M1V0 245 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 KIAA1524Q8TCG1 905 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 ST14Q9Y5Y6 855 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 ADAMTS20P59510 1910 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 USP12O75317 370 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXB3-202ENST00000460160 PMPCBO75439 489 aa23.54■■□□□ 1.36
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