RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	14.58	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	CYP1B1	Q16678	543 aa		14.58	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		14.58	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		14.58	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	14.58	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	14.58	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		14.58	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	FICD	Q9BVA6	458 aa		14.58	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		14.58	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		14.58	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		14.58	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	SPAST	Q9UBP0	616 aa		14.58	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	KL	Q9UEF7	1012 aa		14.58	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	OR1A2	Q9Y585	309 aa		14.58	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		14.58	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	CTAGE9	A4FU28	777 aa		14.57	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241		K7ESM1	405 aa		14.57	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	TPP1	O14773	563 aa		14.57	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	SCAMP1	O15126	338 aa		14.57	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	SH3BP5	O60239	455 aa		14.57	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	KCNK5	O95279	499 aa		14.57	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	METTL18	O95568	372 aa		14.57	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	SOD1	P00441	154 aa		14.57	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	AGT	P01019	485 aa		14.57	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	IFNB1	P01574	187 aa		14.57	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	ALPPL2	P10696	532 aa		14.57	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	JUND	P17535	347 aa		14.57	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	14.57	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	HK3	P52790	923 aa		14.57	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	14.57	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	SEMA5A	Q13591	1074 aa		14.57	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	SNX1	Q13596	522 aa		14.57	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	PTPRR	Q15256	657 aa		14.57	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	14.57	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	HS1BP3	Q53T59	392 aa		14.57	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		14.57	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		14.57	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		14.57	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		14.57	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	14.57	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	PRELID2	Q8N945	189 aa		14.57	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		14.57	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		14.57	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	14.57	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	EID2B	Q96D98	161 aa		14.57	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	14.57	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	HIC2	Q96JB3	615 aa		14.57	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	SMIM14	Q96QK8	99 aa		14.57	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	14.57	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	14.57	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		14.57	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	RNF14	Q9UBS8	474 aa		14.57	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		14.57	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	PKP3	Q9Y446	797 aa		14.57	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	SPTBN2	O15020	2390 aa		14.57	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		14.56	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	C2orf81	A6NN90	581 aa		14.56	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		14.56	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	AP3B1	O00203	1094 aa		14.56	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	AQP9	O43315	295 aa		14.56	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	SUN1	O94901	812 aa		14.56	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	CRTAM	O95727	393 aa		14.56	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	GPR89B	P0CG08	455 aa		14.56	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	CHRNA4	P43681	627 aa		14.56	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	FNTA	P49354	379 aa		14.56	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	CDK16	Q00536	496 aa		14.56	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	LAMB3	Q13751	1172 aa		14.56	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	ELOC	Q15369	112 aa		14.56	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	ALG11	Q2TAA5	492 aa		14.56	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		14.56	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		14.56	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		14.56	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		14.56	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		14.56	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		14.56	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	PELI3	Q8N2H9	469 aa		14.56	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		14.56	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		14.56	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		14.56	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		14.56	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	14.56	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	OR4C6	Q8NH72	309 aa		14.56	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		14.56	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	COG1	Q8WTW3	980 aa		14.56	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	SCAMP4	Q969E2	229 aa		14.56	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	COX14	Q96I36	57 aa		14.56	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	WDR24	Q96S15	920 aa		14.56	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	14.56	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		14.56	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		14.56	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	IL17C	Q9P0M4	197 aa		14.56	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	VPS18	Q9P253	973 aa		14.56	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	14.56	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		14.56	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		14.56	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		14.56	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	14.56	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	14.55	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241		A0A0U1RQS6	177 aa		14.55	□□□□□ -0.08
PTPA-222	ENST00000445241	PRSS38	A1L453	326 aa		14.55	□□□□□ -0.08

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