RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 FLNCQ14315 2725 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 SMTNL1A8MU46 457 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 KCNJ18B7U540 433 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 K7ERI5 159 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 VILLO15195 856 aa6.44□□□□□ -1.38
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PTPRK-211ENST00000429595 CD27P26842 260 aa6.44□□□□□ -1.38
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PTPRK-211ENST00000429595 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP6.44□□□□□ -1.38
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PTPRK-211ENST00000429595 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 PCDHA7Q9UN72 937 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 HPSEQ9Y251 543 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
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PTPRK-211ENST00000429595 OR10T2Q8NGX3 314 aa6.43□□□□□ -1.38
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PTPRK-211ENST00000429595 BTBD1Q9H0C5 482 aa6.43□□□□□ -1.38
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PTPRK-211ENST00000429595 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
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PTPRK-211ENST00000429595 TPM4P67936 248 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 TSPY1Q01534 308 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 MALLQ13021 153 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 STK3Q13188 491 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 MTM1Q13496 603 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 KCNT1Q5JUK3 1230 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.42□□□□□ -1.38
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