RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419302.1

PDCL2P1-201, Transcript of phosducin-like 2 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PDCL2P1, Length 352 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2P1-201ENST00000419302 LINC00479Q96M42 142 aa2.77□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 QRFPRQ96P65 431 aa2.77□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 EGFL8Q99944 293 aa2.77□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 FAM167BQ9BTA0 163 aa2.77□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa2.77□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 KIAA1456Q9P272 454 aa2.77□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 PAK5Q9P286 719 aa2.77□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP2.77□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 MEIOCA2RUB1 952 aa2.76□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 FAM90A7PA6NKC0 464 aa2.76□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 FAM90A22PA8MWA6 464 aa2.76□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 FAM90A12PA8MX19 464 aa2.76□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa2.76□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 KLK10O43240 276 aa2.76□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 ARHGEF9O43307 516 aa2.76□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 DCTP40126 519 aa2.76□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 TBX4P57082 545 aa2.76□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 FOXM1Q08050 763 aa2.76□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 TCTE1Q5JU00 501 aa2.76□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 SUSD1Q6UWL2 747 aa2.76□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa2.76□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 TMTC1Q8IUR5 882 aa2.76□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 SPATA6LQ8N4H0 392 aa2.76□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 ANKRD52Q8NB46 1076 aa2.76□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 OR52I2Q8NH67 350 aa2.76□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 SVIPQ8NHG7 77 aa2.76□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 ZNF653Q96CK0 615 aa2.76□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 EYA3Q99504 573 aa2.76□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 POLG2Q9UHN1 485 aa2.76□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 FAM106CPP0CH98 169 aa2.75□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 GNB3P16520 340 aa2.75□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 SORDQ00796 357 aa2.75□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 ITGA9Q13797 1035 aa2.75□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 SGO1Q5FBB7 561 aa2.75□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 ZNF667Q5HYK9 610 aa2.75□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 SPINK14Q6IE38 97 aa2.75□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 TDRPQ86YL5 185 aa2.75□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 TNIP2Q8NFZ5 429 aa2.75□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 TMEM190Q8WZ59 177 aa2.75□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 TAAR8Q969N4 342 aa2.75□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 TRIM51Q9BSJ1 452 aa2.75□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 TAOK3Q9H2K8 898 aa2.75□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 PLCB1Q9NQ66 1216 aa2.75□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 RASSF1Q9NS23 344 aa2.75□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa2.75□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 ACSL5Q9ULC5 683 aa2.75□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 ERVK-11Q9UQG0 969 aa2.75□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 PTPRCP08575 1304 aa2.74□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 TAF1P21675 1872 aa2.74□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa2.74□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 VWA3AA6NCI4 1184 aa2.74□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa2.74□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 PLIN5Q00G26 463 aa2.74□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 C2orf68Q2NKX9 166 aa2.74□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 GPR180Q86V85 440 aa2.74□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 C2CD5Q86YS7 1000 aa2.74□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 USP38Q8NB14 1042 aa2.74□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 C11orf65Q8NCR3 313 aa2.74□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 VPS37AQ8NEZ2 397 aa2.74□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 HUS1BQ8NHY5 278 aa2.74□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 SLC38A5Q8WUX1 472 aa2.74□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa2.74□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 RUFY2Q8WXA3 655 aa2.74□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 RILPL2Q969X0 211 aa2.74□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 ORAI1Q96D31 301 aa2.74□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 COG8Q96MW5 612 aa2.74□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 PCYT2Q99447 389 aa2.74□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 KCNN2Q9H2S1 579 aa2.74□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa2.74□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 MMP25Q9NPA2 562 aa2.74□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 FEM1BQ9UK73 627 aa2.74□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 JRKLQ9Y4A0 524 aa2.74□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 CACNA1FO60840 1977 aa2.73□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 TSPAN3O60637 253 aa2.73□□□□□ -1.97
PDCL2P1-201ENST00000419302 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms