RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414253.5

FAAP20-206, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,216 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-206ENST00000414253 ZUFSPQ96AP4 578 aa24.51■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 ATXN3LQ9H3M9 355 aa24.51■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 PEX11BO96011 259 aa24.51■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 YWHAQP27348 245 aa24.51■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 MAGEA11P43364 429 aa24.51■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 EFEMP1Q12805 493 aa24.51■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 MS4A13Q5J8X5 152 aa24.51■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 SLC22A9Q8IVM8 553 aa24.51■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa24.51■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa24.51■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 PHF21BQ96EK2 531 aa24.51■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 HSPBAP1Q96EW2 488 aa24.51■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 OSBPL6Q9BZF3 934 aa24.51■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 GSTO2Q9H4Y5 243 aa24.51■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 PLGRKTQ9HBL7 147 aa24.51■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 CREBZFQ9NS37 354 aa24.51■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 STX1BP61266 288 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 ZBED5Q49AG3 693 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 PITRM1Q5JRX3 1037 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 CYHR1Q6ZMK1 362 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 CAMK1DQ8IU85 385 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 FUNDC1Q8IVP5 155 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 LRRC43Q8N309 656 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 ISOC1Q96CN7 298 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 IL37Q9NZH6 218 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 BPTFQ12830 3046 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 SAC3D1A6NKF1 404 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 MYF6P23409 242 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 CHRNA4P43681 627 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 NME5P56597 212 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 FAM171A1Q5VUB5 890 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 TNIP2Q8NFZ5 429 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 FAM110BQ8TC76 370 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 RAET1EQ8TD07 263 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 B3GALT6Q96L58 329 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 TRMOQ9BU70 441 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 PRKD2Q9BZL6 878 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 ZYG11BQ9C0D3 744 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 SMOXQ9NWM0 555 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 MIA3Q5JRA6 1907 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 BBIP1A8MTZ0 92 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 DLGAP1O14490 977 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 SOAT2O75908 522 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 CNTN5O94779 1100 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 TBX18O95935 607 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 RHOQP17081 205 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 STT3AP46977 705 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 SEPT6Q14141 434 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 ACAP2Q15057 778 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 CLEC6AQ6EIG7 209 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 CBR4Q8N4T8 237 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 TMEM161AQ9NX61 479 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 AQP12BA6NM10 295 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 MAGEB3O15480 346 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 RPL10P27635 214 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 CLCN5P51795 746 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 WNT3AP56704 352 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 PCSK7Q16549 785 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 ALFQ53S48 1182 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 ZNF789Q5FWF6 425 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 TBCELQ5QJ74 424 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 KDELC1Q6UW63 502 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 GPR180Q86V85 440 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 SPNS2Q8IVW8 549 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 AQP12AQ8IXF9 295 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 ZNF786Q8N393 782 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 HMCESQ96FZ2 354 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 TRIM15Q9C019 465 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 SLC25A51Q9H1U9 297 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 EBF1Q9UH73 591 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 FAM92AA1XBS5 289 aa24.48■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 J3KR12 359 aa24.48■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 MT-CO1P00395 513 aa24.48■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 GNAO1P09471 354 aa24.48■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 IMPDH1P20839 514 aa24.48■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 GPX3P22352 226 aa24.48■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 RENBPP51606 427 aa24.48■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 SLC14A2Q15849 920 aa24.48■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 RETREG3Q86VR2 466 aa24.48■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 KLHL23Q8NBE8 558 aa24.48■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 SLC43A3Q8NBI5 491 aa24.48■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 TSPAN17Q96FV3 270 aa24.48■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 UBXN10Q96LJ8 280 aa24.48■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 ADI1Q9BV57 179 aa24.48■■□□□ 1.51
FAAP20-206ENST00000414253 GPR62Q9BZJ7 368 aa24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms