RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414241.7

RBBP4-204, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RBBP4, Length 1,788 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4-204ENST00000414241 BNIP3LO60238 219 aa14.65□□□□□ -0.06
RBBP4-204ENST00000414241 SRP72O76094 671 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RBBP4-204ENST00000414241 ESR1P03372 595 aa14.65□□□□□ -0.06
RBBP4-204ENST00000414241 CCDC166P0CW27 439 aa14.65□□□□□ -0.06
RBBP4-204ENST00000414241 FCARP24071 287 aa14.65□□□□□ -0.06
RBBP4-204ENST00000414241 GMPRP36959 345 aa14.65□□□□□ -0.06
RBBP4-204ENST00000414241 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RBBP4-204ENST00000414241 ARFIP2P53365 341 aa14.65□□□□□ -0.06
RBBP4-204ENST00000414241 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RBBP4-204ENST00000414241 FCHO2Q0JRZ9 810 aa14.65□□□□□ -0.06
RBBP4-204ENST00000414241 OVGP1Q12889 678 aa14.65□□□□□ -0.06
RBBP4-204ENST00000414241 ADAM15Q13444 863 aa14.65□□□□□ -0.06
RBBP4-204ENST00000414241 ITGA9Q13797 1035 aa14.65□□□□□ -0.06
RBBP4-204ENST00000414241 ZNF460Q14592 562 aa14.65□□□□□ -0.06
RBBP4-204ENST00000414241 GPR33Q49SQ1 333 aa14.65□□□□□ -0.06
RBBP4-204ENST00000414241 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RBBP4-204ENST00000414241 SNX20Q7Z614 316 aa14.65□□□□□ -0.06
RBBP4-204ENST00000414241 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RBBP4-204ENST00000414241 TDHQ8IZJ6 230 aa14.65□□□□□ -0.06
RBBP4-204ENST00000414241 CPA6Q8N4T0 437 aa14.65□□□□□ -0.06
RBBP4-204ENST00000414241 EID2BQ96D98 161 aa14.65□□□□□ -0.06
RBBP4-204ENST00000414241 ASIC4Q96FT7 647 aa14.65□□□□□ -0.06
RBBP4-204ENST00000414241 EBF3Q9H4W6 596 aa14.65□□□□□ -0.06
RBBP4-204ENST00000414241 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RBBP4-204ENST00000414241 LMCD1Q9NZU5 365 aa14.65□□□□□ -0.06
RBBP4-204ENST00000414241 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RBBP4-204ENST00000414241 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa14.65□□□□□ -0.06
RBBP4-204ENST00000414241 MIA3Q5JRA6 1907 aa14.64□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 CLDN7O95471 211 aa14.64□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 UGT2B4P06133 528 aa14.64□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 PKMP14618 531 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 ARSAP15289 507 aa14.64□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 ITGALP20701 1170 aa14.64□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 SERPINB5P36952 375 aa14.64□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 DNAJB13P59910 316 aa14.64□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 DLG1Q12959 904 aa14.64□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 CSHL1Q14406 222 aa14.64□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 SPDYAQ5MJ70 313 aa14.64□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 UGT3A1Q6NUS8 523 aa14.64□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 CRTC1Q6UUV9 634 aa14.64□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 TAS2R42Q7RTR8 314 aa14.64□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 ZSWIM9Q86XI8 627 aa14.64□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 PIANPQ8IYJ0 282 aa14.64□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa14.64□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 LRRC37BQ96QE4 947 aa14.64□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 BRD9Q9H8M2 597 aa14.64□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 XPR1Q9UBH6 696 aa14.64□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 DKK3Q9UBP4 350 aa14.64□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 TSPAN11A1L157 253 aa14.63□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 F8W8V4 182 aa14.63□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 TRIM24O15164 1050 aa14.63□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 VPS26AO75436 327 aa14.63□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 RHOBTB1O94844 696 aa14.63□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 SBK3P0C264 359 aa14.63□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 FMO4P31512 558 aa14.63□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 SPAM1P38567 509 aa14.63□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 GLRBP48167 497 aa14.63□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 HK2P52789 917 aa14.63□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 PTPRRQ15256 657 aa14.63□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 PTPRNQ16849 979 aa14.63□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 TECRLQ5HYJ1 363 aa14.63□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 CES4AQ5XG92 561 aa14.63□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 TANGO2Q6ICL3 276 aa14.63□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa14.63□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa14.63□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 YAF2Q8IY57 180 aa14.63□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 CHST14Q8NCH0 376 aa14.63□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa14.63□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 KCNJ9Q92806 393 aa14.63□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 RIPOR3Q96MK2 946 aa14.63□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 KLHL32Q96NJ5 620 aa14.63□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 APOL5Q9BWW9 433 aa14.63□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 IL26Q9NPH9 171 aa14.63□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 IL36AQ9UHA7 158 aa14.63□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 DCTN4Q9UJW0 460 aa14.63□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 A0A0G2JND7 137 aa14.62□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa14.62□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 TTC34A8MYJ7 566 aa14.62□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 H3BMM5 538 aa14.62□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 TK2O00142 265 aa14.62□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 LINC01565O15544 149 aa14.62□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 DNAJC6O75061 913 aa14.62□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 ZNF30P17039 623 aa14.62□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 CORO7P57737 925 aa14.62□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 ATP6V0D1P61421 351 aa14.62□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 NFATC2Q13469 925 aa14.62□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 GALNTL6Q49A17 601 aa14.62□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 C12orf40Q86WS4 652 aa14.62□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 SLC22A9Q8IVM8 553 aa14.62□□□□□ -0.07
RBBP4-204ENST00000414241 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms