RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412640.6

SOX9-AS1-201, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 635 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SERPINB6P35237 376 aa9.59□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MAGEA4P43358 317 aa9.59□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GALNT2Q10471 571 aa9.59□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC29A2Q14542 456 aa9.59□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TTMPQ5BVD1 217 aa9.59□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 AGBL2Q5U5Z8 902 aa9.59□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KLHDC10Q6PID8 442 aa9.59□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZFAND4Q86XD8 727 aa9.59□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF683Q8IZ20 524 aa9.59□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FBXO39Q8N4B4 442 aa9.59□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LZTR1Q8N653 840 aa9.59□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR14C36Q8NHC7 312 aa9.59□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RNF34Q969K3 372 aa9.59□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ARL8AQ96BM9 186 aa9.59□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HDAC11Q96DB2 347 aa9.59□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TTC25Q96NG3 672 aa9.59□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OMDQ99983 421 aa9.59□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FERMT1Q9BQL6 677 aa9.59□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KLC2Q9H0B6 622 aa9.59□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NLGN3Q9NZ94 848 aa9.59□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NINJ2Q9NZG7 142 aa9.59□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SEPT10Q9P0V9 454 aa9.59□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa9.59□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PDZD2O15018 2839 aa9.59□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TBC1D3EA0A087X179 549 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TBC1D3LB9A6J9 549 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 K7ESM1 405 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MAGEC1O60732 1142 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM63AO94886 807 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HMBSP08397 361 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TBC1D3HP0C7X1 549 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MYZAPP0CAP1 466 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 VAV1P15498 845 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TPSB2P20231 275 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 EPHB2P29323 1055 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 UGT1A5P35504 534 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PDX1P52945 283 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ARL4CP56559 192 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TBX4P57082 545 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CDK16Q00536 496 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SEMA5AQ13591 1074 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 STAT4Q14765 748 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TPSAB1Q15661 275 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CST6Q15828 149 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HIF1AQ16665 826 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PERM1Q5SV97 790 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CEP85LQ5SZL2 805 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ANKRD22Q5VYY1 191 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 AFMIDQ63HM1 303 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CENPUQ71F23 418 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CHST9Q7L1S5 443 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TADA2BQ86TJ2 420 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IQCHQ86VS3 1027 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CCDC25Q86WR0 208 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LRRC49Q8IUZ0 686 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MCUQ8NE86 351 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR2W6PQ8NHA6 318 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DDI1Q8WTU0 396 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TBC1D31Q96DN5 1066 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PGM2Q96G03 612 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 POM121Q96HA1 1249 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BTN2A3PQ96KV6 586 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SPATA13Q96N96 652 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TSGA13Q96PP4 275 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC12A9Q9BXP2 914 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RETREG1Q9H6L5 497 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 EVA1BQ9NVM1 165 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SUN2Q9UH99 717 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TUBD1Q9UJT1 453 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ACSL6Q9UKU0 697 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SCML1Q9UN30 329 aa9.58□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa9.57□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GOLGA6CA6NDK9 693 aa9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms