RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 TMEM39BQ9GZU3 492 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 CCSER2Q9H7U1 834 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 NEK6Q9HC98 313 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 ITM2CQ9NQX7 267 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 PXMP2Q9NR77 195 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 PLCL2Q9UPR0 1127 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 ROBO3Q96MS0 1386 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 CASZ1Q86V15 1759 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 KPNA5O15131 536 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 DHX15O43143 795 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 TULP3O75386 442 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 CDH1P12830 882 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 TPSB2P20231 275 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 MMP8P22894 467 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 CD86P42081 329 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 SLC15A1P46059 708 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 SLC11A2P49281 568 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 TLR1Q15399 786 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 TPSAB1Q15661 275 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 ZACNQ401N2 412 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 STX12Q86Y82 276 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 DCAKDQ8WVC6 231 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 ITCHQ96J02 903 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 SLC38A2Q96QD8 506 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 C1orf21Q9H246 121 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 PIGUQ9H490 435 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 VWA7Q9Y334 891 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 HSPB11Q9Y547 144 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 SLC12A8A0AV02 714 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 ELOVL7A1L3X0 281 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 HTR3EA5X5Y0 456 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 CLIC3O95833 236 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 CD48P09326 243 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 ODC1P11926 461 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 CYP2A7P20853 494 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 MPP2Q14168 576 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 SPATA19Q7Z5L4 167 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 STARD8Q92502 1023 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 OR52B2Q96RD2 323 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 AMBNQ9NP70 447 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 OR12D3Q9UGF7 316 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 B3GAT3O94766 335 aa9.77□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 TMEM63AO94886 807 aa9.77□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 FGFR1P11362 822 aa9.77□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 AOC1P19801 751 aa9.77□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 TGFBR2P37173 567 aa9.77□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 PIK3CGP48736 1102 aa9.77□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 SLC18A1P54219 525 aa9.77□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 PTP4A2Q12974 167 aa9.77□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 NPTX1Q15818 432 aa9.77□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 HYIQ5T013 277 aa9.77□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 ZPBP2Q6X784 338 aa9.77□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 MON1BQ7L1V2 547 aa9.77□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 LZTR1Q8N653 840 aa9.77□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 FAM151AQ8WW52 585 aa9.77□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 WNT8BQ93098 351 aa9.77□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 AZIN2Q96A70 460 aa9.77□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 CHIAQ9BZP6 476 aa9.77□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 TMEM9Q9P0T7 183 aa9.77□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa9.77□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 PSMD10O75832 226 aa9.77□□□□□ -0.85
HERC3-202ENST00000402738 TYMPP19971 482 aa9.77□□□□□ -0.85
HERC3-202ENST00000402738 SHMT1P34896 483 aa9.77□□□□□ -0.85
HERC3-202ENST00000402738 LIMK2P53671 638 aa9.77□□□□□ -0.85
HERC3-202ENST00000402738 DCDC1P59894 354 aa9.77□□□□□ -0.85
HERC3-202ENST00000402738 DAG1Q14118 895 aa9.77□□□□□ -0.85
HERC3-202ENST00000402738 PGM5Q15124 567 aa9.77□□□□□ -0.85
HERC3-202ENST00000402738 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
HERC3-202ENST00000402738 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa9.77□□□□□ -0.85
HERC3-202ENST00000402738 ELMOD1Q8N336 334 aa9.77□□□□□ -0.85
HERC3-202ENST00000402738 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
HERC3-202ENST00000402738 FETUBQ9UGM5 382 aa9.77□□□□□ -0.85
HERC3-202ENST00000402738 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa9.77□□□□□ -0.85
HERC3-202ENST00000402738 LRCH4O75427 683 aa9.77□□□□□ -0.85
HERC3-202ENST00000402738 OR5F1O95221 314 aa9.77□□□□□ -0.85
HERC3-202ENST00000402738 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
HERC3-202ENST00000402738 IFNA16P05015 189 aa9.77□□□□□ -0.85
HERC3-202ENST00000402738 RHOCP08134 193 aa9.77□□□□□ -0.85
HERC3-202ENST00000402738 ITGA3P26006 1051 aa9.77□□□□□ -0.85
HERC3-202ENST00000402738 MPP1Q00013 466 aa9.77□□□□□ -0.85
HERC3-202ENST00000402738 EVX2Q03828 476 aa9.77□□□□□ -0.85
HERC3-202ENST00000402738 GBE1Q04446 702 aa9.77□□□□□ -0.85
HERC3-202ENST00000402738 TIGD6Q17RP2 521 aa9.77□□□□□ -0.85
HERC3-202ENST00000402738 WSCD2Q2TBF2 565 aa9.77□□□□□ -0.85
HERC3-202ENST00000402738 FSTL4Q6MZW2 842 aa9.77□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms