RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 HEMGNQ9BXL5 484 aa20.17■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 IMPACTQ9P2X3 320 aa20.17■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 POLD2P49005 469 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 DOK6Q6PKX4 331 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 BBS12Q6ZW61 710 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM46DQ8NEK8 389 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 SPATA22Q8NHS9 363 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 CCL4L1Q8NHW4 92 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 TADA1Q96BN2 335 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 TEKT5Q96M29 485 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 DEPDC7Q96QD5 511 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 AGAP2Q99490 1192 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 NRSN2Q9GZP1 204 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 MTSS1O43312 755 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 FUCA1P04066 466 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 GNPDA1P46926 289 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 WASHC5Q12768 1159 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC14A2Q15849 920 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 TRIM74Q86UV6 250 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 NLRP8Q86W28 1048 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 CCHCR1Q8TD31 782 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC3Q9BQI4 270 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 DESI2Q9BSY9 194 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 UBP1Q9NZI7 540 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 SUFUQ9UMX1 484 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 AK5Q9Y6K8 562 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC66A2RUB6 948 aa20.14■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 GRID2IPA4D2P6 1211 aa20.14■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 INPP4BO15327 924 aa20.14■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 CSO75390 466 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 PMPCBO75439 489 aa20.14■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 PYGLP06737 847 aa20.14■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 PIRTP0C851 137 aa20.14■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 CTNNA2P26232 953 aa20.14■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 SPINT3P49223 89 aa20.14■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 COPS2P61201 443 aa20.14■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 CDK18Q07002 472 aa20.14■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 RTP5Q14D33 572 aa20.14■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC181Q5TID7 509 aa20.14■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 LRRC57Q8N9N7 239 aa20.14■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC74AQ96AQ1 378 aa20.14■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 HIC2Q96JB3 615 aa20.14■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 HERPUD2Q9BSE4 406 aa20.14■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 PKD2L2Q9NZM6 624 aa20.14■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 RAXQ9Y2V3 346 aa20.14■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa20.14■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 MACROD2A1Z1Q3 448 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 HACD1B0YJ81 288 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 B4DGG1 531 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 CASC3O15234 703 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 APOC2P02655 101 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 IVLP07476 585 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 NFKB1P19838 968 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 CD68P34810 354 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 RWDD2BP57060 319 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP20.13■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC70Q6NSX1 233 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 SFTPA2Q8IWL1 248 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF567Q8N184 647 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 GPR156Q8NFN8 814 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 GPBAR1Q8TDU6 330 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 HTR3CQ8WXA8 447 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 WDR24Q96S15 920 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 GSDMCQ9BYG8 508 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 OSBPL8Q9BZF1 889 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 DPEP2Q9H4A9 486 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM83DQ9H4H8 585 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 TRIM10Q9UDY6 481 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 RABGEF1Q9UJ41 708 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 SHOC2Q9UQ13 582 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 ACACAQ13085 2346 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 APC2O95996 2303 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 A0A0U1RQJ8 604 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 RGSL1A5PLK6 1076 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 F5H423 210 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 H7C0C1 242 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 NOBOXO60393 691 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 NDST3O95803 873 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC4A1P02730 911 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 ATP5OP48047 213 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 KIF5AQ12840 1032 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 XRCC4Q13426 336 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 ISXQ2M1V0 245 aa20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms