RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 NPNTQ6UXI9 565 aa7.65□□□□□ -1.18
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SGMS1-201ENST00000361543 Q6ZVL8 140 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 DAAM2Q86T65 1068 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
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SGMS1-201ENST00000361543 LPCAT1Q8NF37 534 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 ARRDC2Q8TBH0 407 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 KIAA1524Q8TCG1 905 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
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SGMS1-201ENST00000361543 ALS2CR12Q96Q35 445 aa7.65□□□□□ -1.18
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SGMS1-201ENST00000361543 TEX101Q9BY14 249 aa7.65□□□□□ -1.18
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SGMS1-201ENST00000361543 SEPT10Q9P0V9 454 aa7.65□□□□□ -1.18
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SGMS1-201ENST00000361543 CHKBQ9Y259 395 aa7.65□□□□□ -1.18
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SGMS1-201ENST00000361543 GPSM3Q9Y4H4 160 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 AK5Q9Y6K8 562 aa7.65□□□□□ -1.18
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SGMS1-201ENST00000361543 B4DGG1 531 aa7.64□□□□□ -1.19
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SGMS1-201ENST00000361543 ADGRE3Q9BY15 652 aa7.64□□□□□ -1.19
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SGMS1-201ENST00000361543 TMEM168Q9H0V1 697 aa7.64□□□□□ -1.19
SGMS1-201ENST00000361543 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
SGMS1-201ENST00000361543 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa7.64□□□□□ -1.19
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SGMS1-201ENST00000361543 CD84Q9UIB8 345 aa7.64□□□□□ -1.19
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SGMS1-201ENST00000361543 ADGRG1Q9Y653 693 aa7.64□□□□□ -1.19
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SGMS1-201ENST00000361543 CASC3O15234 703 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
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SGMS1-201ENST00000361543 NUDT7P0C024 238 aa7.63□□□□□ -1.19
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SGMS1-201ENST00000361543 GPR1P46091 355 aa7.63□□□□□ -1.19
SGMS1-201ENST00000361543 GNPDA1P46926 289 aa7.63□□□□□ -1.19
SGMS1-201ENST00000361543 NR2C2P49116 596 aa7.63□□□□□ -1.19
SGMS1-201ENST00000361543 COPS2P61201 443 aa7.63□□□□□ -1.19
SGMS1-201ENST00000361543 GABREP78334 506 aa7.63□□□□□ -1.19
SGMS1-201ENST00000361543 PTSQ03393 145 aa7.63□□□□□ -1.19
SGMS1-201ENST00000361543 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP7.63□□□□□ -1.19
SGMS1-201ENST00000361543 SPIDRQ14159 915 aa7.63□□□□□ -1.19
SGMS1-201ENST00000361543 GALNT3Q14435 633 aa7.63□□□□□ -1.19
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