RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356384.4

RXRA-201, Transcript of retinoid X receptor alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RXRA, Length 5,770 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRA-201ENST00000356384 CSH2P0DML3 217 aa16.04■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 CDK18Q07002 472 aa16.04■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa16.04■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 IQSEC1Q6DN90 963 aa16.04■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 RTL4Q6ZR62 310 aa16.04■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 FAM83AQ86UY5 434 aa16.04■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 ZNF670Q9BS34 389 aa16.04■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 SGK2Q9HBY8 427 aa16.04■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 FGBP02675 491 aa16.04■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 PPIBP23284 216 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 ALDH3A2P51648 485 aa16.04■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 CPTPQ5TA50 214 aa16.04■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 FAM91A1Q658Y4 838 aa16.04■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 GK5Q6ZS86 529 aa16.04■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa16.04■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 CCDC36Q8IYA8 594 aa16.04■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 GSTCDQ8NEC7 633 aa16.04■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 LPPQ93052 612 aa16.04■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 TP53INP1Q96A56 240 aa16.04■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 NEUROD4Q9HD90 331 aa16.04■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 ITPKAP23677 461 aa16.04■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 CHSY3Q70JA7 882 aa16.04■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 CMC1Q7Z7K0 106 aa16.04■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 OR6K2Q8NGY2 324 aa16.04■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 HELQQ8TDG4 1101 aa16.04■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP16.04■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 FAM172BPA6NC97 362 aa16.04■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 AP2A2O94973 939 aa16.04■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 GNRH1P01148 92 aa16.04■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 TRBC1P01850 177 aa16.04■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 CXCR3P49682 368 aa16.04■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 PSEN1P49768 467 aa16.04■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 ZNF730Q6ZMV8 503 aa16.04■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 RBFAQ8N0V3 343 aa16.04■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 GLIS3Q8NEA6 775 aa16.04■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 COPS5Q92905 334 aa16.04■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 FATE1Q969F0 183 aa16.04■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 CITED4Q96RK1 184 aa16.04■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 EXD2Q9NVH0 621 aa16.04■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa16.04■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 A0A0J9YYE9 177 aa16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 DRD4P21917 467 aa16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 CUZD1Q86UP6 607 aa16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 ANKRD52Q8NB46 1076 aa16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 RNF31Q96EP0 1072 aa16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 TSSK3Q96PN8 268 aa16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 VWA7Q9Y334 891 aa16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 IRGMA1A4Y4 181 aa16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 SAGP10523 405 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 TNFRSF8P28908 595 aa16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 ZBTB6Q15916 424 aa16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 LPCAT4Q643R3 524 aa16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 C1orf186Q6ZWK4 172 aa16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 LRRC19Q9H756 370 aa16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 PFDN2Q9UHV9 154 aa16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 DMTF1Q9Y222 760 aa16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 TRAF6Q9Y4K3 522 aa16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 A0A0U1RQJ8 604 aa16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 CLDN5O00501 218 aa16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 UGT2B11O75310 529 aa16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 ELFN1P0C7U0 828 aa16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 TNFSF9P41273 254 aa16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 PLET1Q6UQ28 207 aa16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 CXCL17Q6UXB2 119 aa16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 PRELID2Q8N945 189 aa16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 ART5Q96L15 291 aa16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 A0A1W2PPM1 405 aa16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 DCLK1O15075 740 aa16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 METTL18O95568 372 aa16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 ARHGAP8P85298 464 aa16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 GPR65Q8IYL9 337 aa16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 GPR152Q8TDT2 470 aa16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 ADAMTS15Q8TE58 950 aa16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 CCDC115Q96NT0 180 aa16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 FAM129BQ96TA1 746 aa16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 MEGF6O75095 1541 aa16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms