RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355540.7

TRRAP-201, Transcript of transformation/transcription domain associated protein, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRRAP, Length 12,590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRRAP-201ENST00000355540 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 NDUFS2O75306 463 aa7.3□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 GJB6O95452 261 aa7.3□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 OSTNP61366 133 aa7.3□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 PSMD5Q16401 504 aa7.3□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 TTLL10Q6ZVT0 673 aa7.3□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 SNX20Q7Z614 316 aa7.3□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 FEZF2Q8TBJ5 459 aa7.3□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 POC1BQ8TC44 478 aa7.3□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 C19orf12Q9NSK7 152 aa7.3□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 TBCCD1Q9NVR7 557 aa7.3□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 NUDT5Q9UKK9 219 aa7.3□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 NOL4O94818 638 aa7.3□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 ADH1AP07327 375 aa7.3□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 EPHX2P34913 555 aa7.3□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 MAP2K4P45985 399 aa7.3□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 ADGRF1Q5T601 910 aa7.3□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 TATDN1Q6P1N9 297 aa7.3□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 ZNF786Q8N393 782 aa7.3□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 TBATAQ96M53 351 aa7.3□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 NYAP2Q9P242 653 aa7.3□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 PADI2Q9Y2J8 665 aa7.3□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 CLPXO76031 633 aa7.3□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 SUPT7LO94864 414 aa7.3□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 GADD45AP24522 165 aa7.3□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 QRICH1Q2TAL8 776 aa7.3□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 C4orf46Q504U0 113 aa7.3□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa7.3□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa7.3□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 HORMAD2Q8N7B1 307 aa7.3□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 LRRC57Q8N9N7 239 aa7.3□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 FBXO32Q969P5 355 aa7.3□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 PCIF1Q9H4Z3 704 aa7.3□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 FADS3Q9Y5Q0 445 aa7.3□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 D6RAR5 112 aa7.3□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 F5H6K3 240 aa7.3□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 OGTO15294 1046 aa7.3□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 HRH2P25021 359 aa7.3□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 HOXA9P31269 272 aa7.3□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 CYCSP99999 105 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 KLRC3Q07444 240 aa7.3□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 LPIN1Q14693 890 aa7.3□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 MFSD10Q14728 455 aa7.3□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 FEM1AQ9BSK4 669 aa7.3□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 NUP98P52948 1817 aa7.29□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 GJE1A6NN92 205 aa7.29□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 KERAO60938 352 aa7.29□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 PKMP14618 531 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 NR6A1Q15406 480 aa7.29□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 COBLL1Q53SF7 1204 aa7.29□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 XKR4Q5GH76 650 aa7.29□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 DERAQ9Y315 318 aa7.29□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 ZNF175Q9Y473 711 aa7.29□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 SERPIND1P05546 499 aa7.29□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 FEN1P39748 380 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 ST3GAL4Q11206 333 aa7.29□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa7.29□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa7.29□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 DAW1Q8N136 415 aa7.29□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 PNMA5Q96PV4 448 aa7.29□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 MFSD1Q9H3U5 465 aa7.29□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 OR2AG2A6NM03 316 aa7.29□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa7.29□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 APOC2P02655 101 aa7.29□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 ENO1P06733 434 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 FOXN2P32314 431 aa7.29□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 AAK1Q2M2I8 961 aa7.29□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 C10orf120Q5SQS8 335 aa7.29□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 TMEM110Q86TL2 294 aa7.29□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 FAM84AQ96KN4 292 aa7.29□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 E2F8A0AVK6 867 aa7.29□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 NUDT14O95848 222 aa7.29□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 LBPP18428 481 aa7.29□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 CNSTQ6PJW8 725 aa7.29□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 HIPK1Q86Z02 1210 aa7.29□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 DNAJB14Q8TBM8 379 aa7.29□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 BRSK1Q8TDC3 778 aa7.29□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa7.29□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 SEC14L1Q92503 715 aa7.29□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 MOAP1Q96BY2 351 aa7.29□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 AGAP3Q96P47 875 aa7.29□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 GPRC5BQ9NZH0 403 aa7.29□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 MCM8Q9UJA3 840 aa7.29□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 AK5Q9Y6K8 562 aa7.29□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 CDK2P24941 298 aa7.29□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 CLCN5P51795 746 aa7.29□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 GAS2L3Q86XJ1 694 aa7.29□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 DHRSXQ8N5I4 330 aa7.29□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 FNDC5Q8NAU1 212 aa7.29□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 TAS1R2Q8TE23 839 aa7.29□□□□□ -1.24
TRRAP-201ENST00000355540 KLHL6Q8WZ60 621 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms