RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 FUNDC1Q8IVP5 155 aa16.34■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 LGI2Q8N0V4 545 aa16.34■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 ASB9Q96DX5 294 aa16.34■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 LRCH3Q96II8 777 aa16.34■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 SLC45A3Q96JT2 553 aa16.34■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 ERVK-6Q9BXR3 956 aa16.34■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 UNC93B1Q9H1C4 597 aa16.34■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 SUN2Q9UH99 717 aa16.34■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa16.34■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa16.34■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 CDK14O94921 469 aa16.34■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 CSPG5O95196 566 aa16.34■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 MTHFD2P13995 350 aa16.34■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 SLC6A4P31645 630 aa16.34■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 MAGEA11P43364 429 aa16.34■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 RGRP47804 291 aa16.34■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 DUSP4Q13115 394 aa16.34■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 C19orf60Q96EN9 201 aa16.34■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 CNBD2Q96M20 576 aa16.34■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 AKTIPQ9H8T0 292 aa16.34■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 AP4B1Q9Y6B7 739 aa16.34■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa16.34■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 MRASO14807 208 aa16.33■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 TLR5O60602 858 aa16.33■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 TACR2P21452 398 aa16.33■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 ACLYP53396 1101 aa16.33■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 ACVR1Q04771 509 aa16.33■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 SATL1Q86VE3 508 aa16.33■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 LPGAT1Q92604 370 aa16.33■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 MID1IP1Q9NPA3 183 aa16.33■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 BCAP29Q9UHQ4 241 aa16.33■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 IKZF3Q9UKT9 509 aa16.33■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 FAM50BQ9Y247 325 aa16.33■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa16.33■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 SPO11Q9Y5K1 396 aa16.33■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa16.33■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 MTMR11A4FU01 709 aa16.33■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 TRIM24O15164 1050 aa16.33■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 DENRO43583 198 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 CA8P35219 290 aa16.33■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 TNK2Q07912 1038 aa16.33■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 SMYD1Q8NB12 490 aa16.33■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 OR4L1Q8NH43 312 aa16.33■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 NCSTNQ92542 709 aa16.33■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 DLG3Q92796 817 aa16.33■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 FEM1CQ96JP0 617 aa16.33■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 PDFQ9HBH1 243 aa16.33■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 WDR37Q9Y2I8 494 aa16.33■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 TRIM43BA6NCK2 446 aa16.32■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa16.32■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 CA12O43570 354 aa16.32■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 NRP2O60462 931 aa16.32■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 RPP40O75818 363 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 OR6B1O95007 311 aa16.32■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 GALK1P51570 392 aa16.32■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 FAM189BP81408 668 aa16.32■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 GRB7Q14451 532 aa16.32■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 GEN1Q17RS7 908 aa16.32■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 RETREG3Q86VR2 466 aa16.32■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 MARVELD2Q8N4S9 558 aa16.32■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 BRSK1Q8TDC3 778 aa16.32■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 CENPKQ9BS16 269 aa16.32■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 SPON2Q9BUD6 331 aa16.32■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 IL1RL2Q9HB29 575 aa16.32■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 CATSPERZQ9NTU4 200 aa16.32■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 SH3GLB1Q9Y371 365 aa16.32■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 FGF1P05230 155 aa16.32■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 HLA-DPA1P20036 260 aa16.32■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 YBX1P67809 324 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 MAP7Q14244 749 aa16.32■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 PTPRRQ15256 657 aa16.32■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 NRF1Q16656 503 aa16.32■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 MRNIPQ6NTE8 343 aa16.32■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 ADCY4Q8NFM4 1077 aa16.32■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 TRPC4APQ8TEL6 797 aa16.32■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa16.32■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 CYP2S1Q96SQ9 504 aa16.32■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 TRMOQ9BU70 441 aa16.32■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 RNF186Q9NXI6 227 aa16.32■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 APPL1Q9UKG1 709 aa16.32■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 A0A0U1RQS6 177 aa16.32■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 PIP5K1BO14986 540 aa16.32■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 SYN3O14994 580 aa16.32■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 SMIM18P0DKX4 95 aa16.32■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 FGFR3P22607 806 aa16.32■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 FMO4P31512 558 aa16.32■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 SLC26A3P40879 764 aa16.32■□□□□ 0.2
SHQ1-201ENST00000325599 RPS24P62847 133 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.7 ms