RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300057.4

MESP1-201, Transcript of mesoderm posterior bHLH transcription factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MESP1, Length 2,369 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1-201ENST00000300057 SPO11Q9Y5K1 396 aa21.46■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 TMEM221A6NGB7 291 aa21.46■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 CCDC160A6NGH7 325 aa21.46■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 RPP40O75818 363 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 TFAP2AP05549 437 aa21.46■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 PRKAA2P54646 552 aa21.46■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 FOLH1Q04609 750 aa21.46■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 ACVR1Q04771 509 aa21.46■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 FAM83EQ2M2I3 478 aa21.46■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 FSCBQ5H9T9 825 aa21.46■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 EPGNQ6UW88 154 aa21.46■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 PIM3Q86V86 326 aa21.46■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 GAB3Q8WWW8 586 aa21.46■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 YME1L1Q96TA2 773 aa21.46■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 SORCS3Q9UPU3 1222 aa21.46■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 RAP2CQ9Y3L5 183 aa21.46■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 NEMP2A6NFY4 417 aa21.45■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 H0Y626 953 aa21.45■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 PPP3CCP48454 512 aa21.45■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 ARF5P84085 180 aa21.45■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 SEMA3AQ14563 771 aa21.45■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 GALNT7Q86SF2 657 aa21.45■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 MARVELD2Q8N4S9 558 aa21.45■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 SLC26A7Q8TE54 656 aa21.45■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 ANKRD49Q8WVL7 239 aa21.45■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 POMKQ9H5K3 350 aa21.45■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 WDR37Q9Y2I8 494 aa21.45■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa21.45■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 E9PBE3 544 aa21.45■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 DENRO43583 198 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 KLHL41O60662 606 aa21.45■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 AOC1P19801 751 aa21.45■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 CR2P20023 1033 aa21.45■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 PEX2P28328 305 aa21.45■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 RNF111Q6ZNA4 994 aa21.45■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 LPCAT1Q8NF37 534 aa21.45■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 SH3RF2Q8TEC5 729 aa21.45■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 Q9H521 79 aa21.45■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa21.45■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa21.44■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 GOLGA8OA6NCC3 632 aa21.44■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 MEI4A8MW99 385 aa21.44■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 GOLGA8NF8WBI6 632 aa21.44■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 F11P03951 625 aa21.44■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 PRSS56P0CW18 603 aa21.44■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 CPOXP36551 454 aa21.44■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 RPL14P50914 215 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 ZXDBP98169 803 aa21.44■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 TECRLQ5HYJ1 363 aa21.44■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 AGAP9Q5VTM2 703 aa21.44■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 POU5F2Q8N7G0 328 aa21.44■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 CYP4F12Q9HCS2 524 aa21.44■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 CATSPERZQ9NTU4 200 aa21.44■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 TBCCD1Q9NVR7 557 aa21.44■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 THEGQ9P2T0 379 aa21.44■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 CPQQ9Y646 472 aa21.44■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 TRIM43BA6NCK2 446 aa21.44■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 NEMP1O14524 444 aa21.44■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 EMP3P54852 163 aa21.44■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 TRIP10Q15642 601 aa21.44■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 MRNIPQ6NTE8 343 aa21.44■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa21.44■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa21.44■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 CRTAMO95727 393 aa21.43■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 HDCP19113 662 aa21.43■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 CYP4F8P98187 520 aa21.43■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 NADK2Q4G0N4 442 aa21.43■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 LSMEM2Q8N112 164 aa21.43■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 OR4L1Q8NH43 312 aa21.43■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa21.43■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 PEX13Q92968 403 aa21.43■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 OR52B2Q96RD2 323 aa21.43■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 IL21Q9HBE4 155 aa21.43■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 VPS28Q9UK41 221 aa21.43■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 RAI2Q9Y5P3 530 aa21.43■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 CD160O95971 181 aa21.43■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 TIMP1P01033 207 aa21.43■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 MYL4P12829 197 aa21.43■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 PRKAA1Q13131 559 aa21.43■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 GPR158Q5T848 1215 aa21.43■■□□□ 1.02
MESP1-201ENST00000300057 SEL1L3Q68CR1 1132 aa21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms