RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298527.10

CLEC1B-201, Transcript of C-type lectin domain family 1 member B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLEC1B, Length 952 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC1B-201ENST00000298527 ARHGAP42A6NI28 874 aa16.09■□□□□ 0.17
CLEC1B-201ENST00000298527 TTLL8A6PVC2 850 aa16.09■□□□□ 0.17
CLEC1B-201ENST00000298527 K7EM74 188 aa16.09■□□□□ 0.17
CLEC1B-201ENST00000298527 RFPL1O75677 317 aa16.09■□□□□ 0.17
CLEC1B-201ENST00000298527 DDAH2O95865 285 aa16.09■□□□□ 0.17
CLEC1B-201ENST00000298527 DLGAP3O95886 979 aa16.09■□□□□ 0.17
CLEC1B-201ENST00000298527 ACTR1BP42025 376 aa16.09■□□□□ 0.17
CLEC1B-201ENST00000298527 FASLGP48023 281 aa16.09■□□□□ 0.17
CLEC1B-201ENST00000298527 POLD2P49005 469 aa16.09■□□□□ 0.17
CLEC1B-201ENST00000298527 SCNN1BP51168 640 aa16.09■□□□□ 0.17
CLEC1B-201ENST00000298527 NDST2P52849 883 aa16.09■□□□□ 0.17
CLEC1B-201ENST00000298527 ACTR1AP61163 376 aa16.09■□□□□ 0.17
CLEC1B-201ENST00000298527 RAET1GQ6H3X3 334 aa16.09■□□□□ 0.17
CLEC1B-201ENST00000298527 DOK6Q6PKX4 331 aa16.09■□□□□ 0.17
CLEC1B-201ENST00000298527 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
CLEC1B-201ENST00000298527 CPT1CQ8TCG5 803 aa16.09■□□□□ 0.17
CLEC1B-201ENST00000298527 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
CLEC1B-201ENST00000298527 COQ10AQ96MF6 247 aa16.09■□□□□ 0.17
CLEC1B-201ENST00000298527 SLC39A8Q9C0K1 460 aa16.09■□□□□ 0.17
CLEC1B-201ENST00000298527 POLHQ9Y253 713 aa16.09■□□□□ 0.17
CLEC1B-201ENST00000298527 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa16.09■□□□□ 0.17
CLEC1B-201ENST00000298527 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa16.08■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 ANKRD62A6NC57 917 aa16.08■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 IVLP07476 585 aa16.08■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 ADCY8P40145 1251 aa16.08■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 CDK3Q00526 305 aa16.08■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 PTP4A2Q12974 167 aa16.08■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 CNGA3Q16281 694 aa16.08■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 TRIM72Q6ZMU5 477 aa16.08■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 MLKLQ8NB16 471 aa16.08■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 SLC38A3Q99624 504 aa16.08■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa16.08■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 DONSONQ9NYP3 566 aa16.08■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa16.08■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 ST14Q9Y5Y6 855 aa16.08■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 DFFAO00273 331 aa16.07■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 CALB1P05937 261 aa16.07■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 UNGP13051 313 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 TEAD1P28347 426 aa16.07■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 AIF1P55008 147 aa16.07■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 C3orf20Q8ND61 904 aa16.07■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 MCEEQ96PE7 176 aa16.07■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 PCDHB18PQ96TA0 734 aa16.07■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 NLRC4Q9NPP4 1024 aa16.07■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 TLK1Q9UKI8 766 aa16.07■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa16.07■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 CACNA1DQ01668 2161 aa16.06■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 SIGLEC16A6NMB1 481 aa16.06■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 INPP4BO15327 924 aa16.06■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 DAPK3O43293 454 aa16.06■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 SEMA7AO75326 666 aa16.06■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 VIPR1P32241 457 aa16.06■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 SOX5P35711 763 aa16.06■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 ETV3P41162 512 aa16.06■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 PMS2P54278 862 aa16.06■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 GSCP56915 257 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 AP1S1P61966 158 aa16.06■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP16.06■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 DNAJC24Q6P3W2 148 aa16.06■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa16.06■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa16.06■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 DTD2Q96FN9 168 aa16.06■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 NSMCE3Q96MG7 304 aa16.06■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 OR2M4Q96R27 311 aa16.06■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 VPS16Q9H269 839 aa16.06■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 GANQ9H2C0 597 aa16.06■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 APMAPQ9HDC9 416 aa16.06■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 KCND3Q9UK17 655 aa16.06■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 CENPEQ02224 2701 aa16.06■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 A1L4Q6 167 aa16.05■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 RECKO95980 971 aa16.05■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 CPP00450 1065 aa16.05■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 DESP17661 470 aa16.05■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 F8A1P23610 371 aa16.05■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 NFKBIAP25963 317 aa16.05■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 DLSTP36957 453 aa16.05■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 KLK7P49862 253 aa16.05■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 ERV3-1Q14264 604 aa16.05■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 GSE1Q14687 1217 aa16.05■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 SYCP1Q15431 976 aa16.05■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 SFRP1Q8N474 314 aa16.05■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 FNIP1Q8TF40 1166 aa16.05■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 SPOCK2Q92563 424 aa16.05■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 CNPY3Q9BT09 278 aa16.05■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 ULBP3Q9BZM4 244 aa16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms