RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 PURAQ00577 322 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 TUBB3Q13509 450 aa8.83□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 ZNF678Q5SXM1 525 aa8.83□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 IL23RQ5VWK5 629 aa8.83□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 PAOXQ6QHF9 649 aa8.83□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 FAM126BQ8IXS8 530 aa8.83□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 SNX31Q8N9S9 440 aa8.83□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 SETD9Q8NE22 299 aa8.83□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 L3HYPDHQ96EM0 354 aa8.83□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 MRGPRX2Q96LB1 330 aa8.83□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 TMEM45AQ9NWC5 275 aa8.83□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 TLL2Q9Y6L7 1015 aa8.83□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 KERAO60938 352 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 CYBBP04839 570 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 SLC2A4P14672 509 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 CHRNA4P43681 627 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 SULT2A1Q06520 285 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 RALGDSQ12967 914 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 SEMA3BQ13214 749 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 BFSP2Q13515 415 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 PTPRNQ16849 979 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 BROXQ5VW32 411 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 ERMP1Q7Z2K6 904 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 EID3Q8N140 333 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 RHEBL1Q8TAI7 183 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 RNF145Q96MT1 663 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 LATS2Q9NRM7 1088 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 CBX4O00257 560 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 PTGESO14684 152 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 ZNF623O75123 536 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 ANXA6P08133 673 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 MAGEA11P43364 429 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 GRIK2Q13002 908 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 FAM171BQ6P995 826 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 IL27RAQ6UWB1 636 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 ANKS3Q6ZW76 656 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 ADHFE1Q8IWW8 467 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 ELMOD1Q8N336 334 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 SFRP1Q8N474 314 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 FATE1Q969F0 183 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 TBATAQ96M53 351 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 CFAP99D6REC4 459 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 E7ENX8 843 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 PIP5K1BO14986 540 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 BUD23O43709 281 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 C1QAP02745 245 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 ETS2P15036 469 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 INHBCP55103 352 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 RAB15P59190 212 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 RFX4Q33E94 735 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 PDPRQ8NCN5 879 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 DNAJB8Q8NHS0 232 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 ZNF778Q96MU6 729 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 C1orf50Q9BV19 199 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 APOL5Q9BWW9 433 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 DERL2Q9GZP9 239 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 ZIM2Q9NZV7 527 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 FAM50BQ9Y247 325 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 A0A0U1RQF3 1178 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 FAM234BA2RU67 622 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 STX16O14662 325 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 PGK1P00558 417 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 CEACAM7Q14002 265 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 GALNT3Q14435 633 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 DDR2Q16832 855 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 SIRPB2Q5JXA9 342 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 ARMC12Q5T9G4 340 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 CLEC6AQ6EIG7 209 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 RETSATQ6NUM9 610 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 DLK2Q6UY11 383 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 CERS6Q6ZMG9 384 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 LRRC8DQ7L1W4 858 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 FAM47BQ8NA70 645 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 KDM1BQ8NB78 822 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 STARD8Q92502 1023 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 SNX19Q92543 992 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 CCDC90BQ9GZT6 254 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 IGSF5Q9NSI5 407 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms