RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229304.4

APOBEC1-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC1, Length 879 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1-201ENST00000229304 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 KCNK13Q9HB14 408 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 NPHS2Q9NP85 383 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 OXSMQ9NWU1 459 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 PKP3Q9Y446 797 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 COMMD10Q9Y6G5 202 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 SHROOM3Q8TF72 1996 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 TSPAN11A1L157 253 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
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APOBEC1-201ENST00000229304 FSBPO95073 299 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 PIGNO95427 931 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 NFATC1O95644 943 aa9.51□□□□□ -0.89
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APOBEC1-201ENST00000229304 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
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APOBEC1-201ENST00000229304 FSHRP23945 695 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 MC4RP32245 332 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 SERPINB5P36952 375 aa9.51□□□□□ -0.89
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APOBEC1-201ENST00000229304 ITGA9Q13797 1035 aa9.51□□□□□ -0.89
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APOBEC1-201ENST00000229304 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
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APOBEC1-201ENST00000229304 KDM1BQ8NB78 822 aa9.51□□□□□ -0.89
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APOBEC1-201ENST00000229304 HEXDCQ8WVB3 486 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 STON2Q8WXE9 905 aa9.51□□□□□ -0.89
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APOBEC1-201ENST00000229304 SCRN2Q96FV2 425 aa9.51□□□□□ -0.89
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APOBEC1-201ENST00000229304 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa9.51□□□□□ -0.89
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APOBEC1-201ENST00000229304 XPR1Q9UBH6 696 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 FKBPLQ9UIM3 349 aa9.51□□□□□ -0.89
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APOBEC1-201ENST00000229304 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 NDUFS3O75489 264 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 ATP5HO75947 161 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 UBOX5O94941 541 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 HNF1BP35680 557 aa9.5□□□□□ -0.89
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APOBEC1-201ENST00000229304 NNMTP40261 264 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 PTGER3P43115 390 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 STK19P49842 368 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 CDKN2DP55273 166 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 PFKPQ01813 784 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
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