RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641187.1

CASC19-217, Transcript of cancer susceptibility 19, humanhuman

Gene CASC19, Length 875 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC19-217ENST00000641187 SQORQ9Y6N5 450 aa3.06□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 V9GYY5 206 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 VWA3AA6NCI4 1184 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 TMCO5BA8MYB1 307 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 UBXN8O00124 270 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 SNAP23O00161 211 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 PCDH17O14917 1159 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 SCAMP1O15126 338 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 TGFB1I1O43294 461 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 PHF2O75151 1096 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 RTN2O75298 545 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 KIAA0754O94854 1291 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 GJB5O95377 273 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 METTL18O95568 372 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 OPN1MWP04001 364 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 ASGR1P07306 291 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 TPM1P09493 284 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 OPN1MW2P0DN77 364 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 OPN1MW3P0DN78 364 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 RAP2AP10114 183 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 AKR1A1P14550 325 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 GCSHP23434 173 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 SP100P23497 879 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 ITPKBP27987 946 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 TMOD1P28289 359 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 TNFRSF8P28908 595 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 ADORA2AP29274 412 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 GRK5P34947 590 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 SULT1E1P49888 294 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 HNMTP50135 292 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 VAV2P52735 878 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 GSCP56915 257 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 TPM4P67936 248 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 GPR68Q15743 365 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 TYSND1Q2T9J0 566 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 TCP11X2Q5H9J9 407 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 TMTC4Q5T4D3 741 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 CCDC183Q5T5S1 534 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 TSTD2Q5T7W7 516 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 ADALQ6DHV7 355 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 WDR93Q6P2C0 686 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 SUSD1Q6UWL2 747 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 IKBIPQ70UQ0 350 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 RRAGAQ7L523 313 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 AMIGO2Q86SJ2 522 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 MON1AQ86VX9 555 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 PPP1R3BQ86XI6 285 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 LINC00346Q8IVM7 164 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 SCN4BQ8IWT1 228 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 FAM217AQ8IXS0 508 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 TAGAPQ8N103 731 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 WDTC1Q8N5D0 677 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 OR6Y1Q8NGX8 325 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 METTL6Q8TCB7 284 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 NCSTNQ92542 709 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 MAP4K1Q92918 833 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 MR1Q95460 341 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 RAB24Q969Q5 203 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 PERPQ96FX8 193 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 SUCLG2Q96I99 432 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 FAM167AQ96KS9 214 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 ABHD1Q96SE0 405 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 SIN3AQ96ST3 1273 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 FUZQ9BT04 418 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 SPXQ9BT56 116 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 FAM107BQ9H098 131 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 BRD8Q9H0E9 1235 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 TRPV6Q9H1D0 765 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 SLC25A18Q9H1K4 315 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 VPS37BQ9H9H4 285 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 IL21RQ9HBE5 538 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 TAS2R3Q9NYW6 316 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-217ENST00000641187 NINJ2Q9NZG7 142 aa3.05□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms