RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639525.1

SPIN3-223, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5 BASIC

Gene SPIN3, Length 3,958 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-223	ENST00000639525	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC9A7	Q96T83	725 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	OLFM1	Q99784	485 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	CLPB	Q9H078	707 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	ALG2	Q9H553	416 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	RERGL	Q9H628	205 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	ACTR8	Q9H981	624 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	RAB26	Q9ULW5	256 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	ALDH1A2	O94788	518 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	ARSD	P51689	593 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	MTPN	P58546	118 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	C1QTNF8	P60827	252 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	RPL38	P63173	70 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	XIAP	P98170	497 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	GALNT2	Q10471	571 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	MYLK3	Q32MK0	819 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	STEAP4	Q687X5	459 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	BNIPL	Q7Z465	357 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	KBTBD6	Q86V97	674 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	MICU2	Q8IYU8	434 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	LINGO1	Q96FE5	620 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	BDH2	Q9BUT1	245 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	VPS45	Q9NRW7	570 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	IRAK2	O43187	625 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	CYP4B1	P13584	511 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	IL2	P60568	153 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	RHOA	P61586	193 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	CDKL1	Q00532	357 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	SULT2A1	Q06520	285 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	DPYS	Q14117	519 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	ADRM1	Q16186	407 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	CENPL	Q8N0S6	344 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	GLMN	Q92990	594 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	GALP	Q9UBC7	116 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	DMTF1	Q9Y222	760 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	NRAP	Q86VF7	1730 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525		A0A1W2PQ67	120 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	IQCF5	A8MTL0	148 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	PTGES	O14684	152 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	TLR5	O60602	858 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	OR4F21	O95013	312 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	COL6A2	P12110	1019 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC11A2	P49281	568 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	CCR3	P51677	355 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	CREB5	Q02930	508 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	LIPE	Q05469	1076 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	MAP2K5	Q13163	448 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	CDH18	Q13634	790 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	ALF	Q53S48	1182 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	DPY30	Q9C005	99 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	COL1A2	P08123	1366 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	BCL10	O95999	233 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	PRDX6	P30041	224 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	PSMD7	P51665	324 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	CLC	Q05315	142 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	ADCK1	Q86TW2	530 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	FBXL20	Q96IG2	436 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	FCRL5	Q96RD9	977 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC29A1	Q99808	456 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	TFPT	P0C1Z6	253 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	AKR1A1	P14550	325 aa		11.74	□□□□□ -0.53

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms