RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 SLC12A2P55011 1212 aa20.5■□□□□ 0.87
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PMS1-222ENST00000639501 LRRC58Q96CX6 371 aa20.5■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 GIN1Q9NXP7 522 aa20.5■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 HOXC10Q9NYD6 342 aa20.5■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 FBXO5Q9UKT4 447 aa20.5■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa20.5■□□□□ 0.87
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PMS1-222ENST00000639501 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
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PMS1-222ENST00000639501 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
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PMS1-222ENST00000639501 GPIP06744 558 aa20.49■□□□□ 0.87
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PMS1-222ENST00000639501 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
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PMS1-222ENST00000639501 SLC52A3Q9NQ40 469 aa20.48■□□□□ 0.87
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PMS1-222ENST00000639501 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 HTR1AP08908 422 aa20.47■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 RAD23AP54725 363 aa20.47■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 SEPT6Q14141 434 aa20.47■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 FUT11Q495W5 492 aa20.47■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 UNC50Q53HI1 259 aa20.47■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 AGAP9Q5VTM2 703 aa20.47■□□□□ 0.87
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