RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635538.1

EP300-208, Transcript of E1A binding protein p300, human

TSL 2

Gene EP300, Length 318 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EP300-208	ENST00000635538	PPEF2	O14830	753 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	SPRY3	O43610	288 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	PGM3	O95394	542 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	FGF2	P09038	288 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	IL11	P20809	199 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	KRT20	P35900	424 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	RFX2	P48378	723 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	ECT2L	Q008S8	904 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	LAMB3	Q13751	1172 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	ZNF284	Q2VY69	593 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	FSCB	Q5H9T9	825 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	SHF	Q7M4L6	423 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	GPT2	Q8TD30	523 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	IGSF8	Q969P0	613 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	APOLD1	Q96LR9	279 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	ACOX2	Q99424	681 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	SIL1	Q9H173	461 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	NDST4	Q9H3R1	872 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	PLK3	Q9H4B4	646 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	GPR108	Q9NPR9	543 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	NENF	Q9UMX5	172 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	CMAHP	Q9Y471	501 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538		A0A1B0GVM2	712 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	LRRC72	A6NJI9	287 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	GLOD5	A6NK44	160 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	CTDSP2	O14595	271 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	MOSPD3	O75425	235 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	GJB3	O75712	270 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	TPPP	O94811	219 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	VNN2	O95498	520 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	TNFRSF1B	P20333	461 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	RRM1	P23921	792 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	THPO	P40225	353 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	ABCG1	P45844	678 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	NRIP1	P48552	1158 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	NUDT6	P53370	316 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	PMS2	P54278	862 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	RABEP1	Q15276	862 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538		Q6ZSV7	163 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538		Q6ZTK2	550 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	ERGIC1	Q969X5	290 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	SETD4	Q9NVD3	440 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	FZD10	Q9ULW2	581 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	VCY	O14598	125 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	P4HA2	O15460	535 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	OGG1	O15527	345 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	ENTPD3	O75355	529 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	FTCD	O95954	541 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	LCAT	P04180	440 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	ACADL	P28330	430 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	FASLG	P48023	281 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	CLCN3	P51790	818 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	PNLIPRP2	P54317	469 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	TRAF2	Q12933	501 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	GRIK2	Q13002	908 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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