RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 NAGSQ8N159 534 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 DPYSL5Q9BPU6 564 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 CNPY3Q9BT09 278 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 TEX101Q9BY14 249 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 AP4E1Q9UPM8 1137 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 SDK2Q58EX2 2172 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 DUX1O43812 170 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB15P59190 212 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-217ENST00000629983 AP1S1P61966 158 aa27.32■■□□□ 1.96
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CAPNS1-217ENST00000629983 CDK3Q00526 305 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-217ENST00000629983 CNGA3Q16281 694 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-217ENST00000629983 SNAP47Q5SQN1 464 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-217ENST00000629983 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC45A3Q96JT2 553 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-217ENST00000629983 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
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CAPNS1-217ENST00000629983 ETV3P41162 512 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-217ENST00000629983 POLD2P49005 469 aa27.31■■□□□ 1.96
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CAPNS1-217ENST00000629983 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-217ENST00000629983 KCTD5Q9NXV2 234 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-217ENST00000629983 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
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CAPNS1-217ENST00000629983 JAM2P57087 298 aa27.3■■□□□ 1.96
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CAPNS1-217ENST00000629983 CDC20Q12834 499 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM71Q6P5X7 295 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-217ENST00000629983 MON1BQ7L1V2 547 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-217ENST00000629983 KDELC2Q7Z4H8 507 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-217ENST00000629983 NLGN4XQ8N0W4 816 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-217ENST00000629983 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
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CAPNS1-217ENST00000629983 LRRK2Q5S007 2527 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-217ENST00000629983 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-217ENST00000629983 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-217ENST00000629983 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-217ENST00000629983 A8MU76 341 aa27.29■■□□□ 1.96
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CAPNS1-217ENST00000629983 NFKBIAP25963 317 aa27.29■■□□□ 1.96
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CAPNS1-217ENST00000629983 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa27.29■■□□□ 1.96
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CAPNS1-217ENST00000629983 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
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CAPNS1-217ENST00000629983 FKBP15Q5T1M5 1219 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-217ENST00000629983 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa27.28■■□□□ 1.96
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CAPNS1-217ENST00000629983 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa27.27■■□□□ 1.96
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CAPNS1-217ENST00000629983 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
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CAPNS1-217ENST00000629983 C16orf46Q6P387 395 aa27.27■■□□□ 1.96
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CAPNS1-217ENST00000629983 ABHD17AQ96GS6 310 aa27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-217ENST00000629983 NSMCE3Q96MG7 304 aa27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-217ENST00000629983 PLAAQ9Y263 795 aa27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1W2PQ67 120 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 GPR1P46091 355 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 CEACAM20Q6UY09 585 aa27.26■■□□□ 1.95
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