RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 HDXQ7Z353 690 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 PARGQ86W56 976 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 IFT81Q8WYA0 676 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 C1orf74Q96LT6 269 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 THSD1Q9NS62 852 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF446Q9NWS9 450 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 WHRNQ9P202 907 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 DNPEPQ9ULA0 475 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF148Q9UQR1 794 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 CAPN8A6NHC0 703 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 CDRT15L2A8MXV6 281 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 DAPK3O43293 454 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 AP1G1O43747 822 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 MYBL2P10244 700 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 CAV1Q03135 178 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 VAC14Q08AM6 782 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 SNX1Q13596 522 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP1R7Q15435 360 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 C3orf38Q5JPI3 329 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 PERM1Q5SV97 790 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 VIPAS39Q9H9C1 493 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 GGT7Q9UJ14 662 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 CHD5Q8TDI0 1954 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 ILVBLA1L0T0 632 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 MAP2K7O14733 419 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 ECHS1P30084 290 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 ABL2P42684 1182 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 PFN3P60673 137 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP1R16AQ96I34 528 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM51Q9BSJ1 452 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 FUT8Q9BYC5 575 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 CEP44Q9C0F1 390 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 ABCG4Q9H172 646 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 NFU1Q9UMS0 254 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 ESYT3A0FGR9 886 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 CFAP69A5D8W1 941 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 AQP9O43315 295 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 IVDP26440 423 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 RABIFP47224 123 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 DEFB133Q30KQ1 61 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 MREGQ8N565 214 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 FEM1CQ96JP0 617 aa24.26■■□□□ 1.47
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CAPNS1-216ENST00000628306 TSPYL1Q9H0U9 437 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 HECTD1Q9ULT8 2610 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 CPED1A4D0V7 1026 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 IGLON5A6NGN9 336 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 K7ENP7 123 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 GCATO75600 419 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 JUNDP17535 347 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 OR1E1P30953 314 aa24.25■■□□□ 1.47
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CAPNS1-216ENST00000628306 CARD16Q5EG05 197 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF783Q6ZMS7 281 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 RBFAQ8N0V3 343 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 ART4Q93070 314 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 GRHL1Q9NZI5 618 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 ITM2BQ9Y287 266 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 TPP1O14773 563 aa24.24■■□□□ 1.47
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CAPNS1-216ENST00000628306 GKP32189 559 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 DYNLT1P63172 113 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 DPYSQ14117 519 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 TRADDQ15628 312 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 CRTC1Q6UUV9 634 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 RFX8Q6ZV50 586 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC35F3Q8IY50 421 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 LMX1AQ8TE12 382 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 ASB12Q8WXK4 309 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 GRAMD1AQ96CP6 724 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 HAUS1Q96CS2 278 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 EPAS1Q99814 870 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 FOXP3Q9BZS1 431 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 PCDH9Q9HC56 1237 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 SNX24Q9Y343 169 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 HACD1B0YJ81 288 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 B8ZZF3 427 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 KRT14P02533 472 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
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