RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 C16orf96A6NNT2 1141 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 A8MX80 341 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 UPK3BL1B0FP48 263 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 UPK3BL2E5RIL1 263 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 TPP1O14773 563 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 RRP9O43818 475 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 S1PR4O95977 384 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 EPHX1P07099 455 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 ASGR2P07307 311 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 OGNP20774 298 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 LHCGRP22888 699 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 MC4RP32245 332 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 FOXN2P32314 431 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 MAGEA12P43365 314 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 XIAPP98170 497 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 SEMA3AQ14563 771 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRC66Q68CR7 880 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 ACMSDQ8TDX5 336 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 GUCY1A3Q02108 690 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 SEMG2Q02383 582 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 PTSQ03393 145 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 TYSND1Q2T9J0 566 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF789Q5FWF6 425 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRC73Q5JTD7 316 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 CNSTQ6PJW8 725 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 PNPLA1Q8N8W4 532 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 ACVR1CQ8NER5 493 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 APOPT1Q96IL0 206 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 NFKBIAP25963 317 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 POLD2P49005 469 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM196Q5HYL7 178 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 TTC7BQ86TV6 843 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 CHPFQ8IZ52 775 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 DENND1AQ8TEH3 1009 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 CAPS2Q9BXY5 557 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 PCDH12Q9NPG4 1184 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 MKS1Q9NXB0 559 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 PRSS56P0CW18 603 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 ITGB7P26010 798 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 VIPR1P32241 457 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 SERPINB8P50452 374 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 CSRP3P50461 194 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 STC1P52823 247 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 PON2Q15165 354 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 POM121L1PQ3SYA9 428 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 DSG4Q86SJ6 1040 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKRD42Q8N9B4 389 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 CENPTQ96BT3 561 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 SNX15Q9NRS6 342 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 NARSO43776 548 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 EGFP01133 1207 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 GLULP15104 373 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF30P17039 623 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 BPIP17213 487 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 TYK2P29597 1187 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 TIE1P35590 1138 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 NEK3P51956 506 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 PTPN5P54829 565 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 SEC13P55735 322 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 IER5LQ5T953 404 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNV2Q8TDN2 545 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 PBXIP1Q96AQ6 731 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 ARRDC3Q96B67 414 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 TCF12Q99081 682 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 PCMTD2Q9NV79 361 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 APPL1Q9UKG1 709 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 A6NNZ2 444 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 COPEO14579 308 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 ZWINTO95229 277 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 IL1BP01584 269 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 C1SP09871 688 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 DRD1P21728 446 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 XPAP23025 273 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 WASP42768 502 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 CLCN5P51795 746 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 METAP1P53582 386 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 PFKPQ01813 784 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 TUBB8Q3ZCM7 444 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms