RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 HORMAD1Q86X24 394 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 ANKMY2Q8IV38 441 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 ZBED8Q8IZ13 594 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 TTC30BQ8N4P2 665 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 DEFB119Q8N690 84 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 OR4K2Q8NGD2 314 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 RUBCNQ92622 972 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 KLK6Q92876 244 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 EID2BQ96D98 161 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 SIGLEC10Q96LC7 697 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 RANBP9Q96S59 729 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 FMO2Q99518 471 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 FOXP3Q9BZS1 431 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 BPIFA1Q9NP55 256 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 SAYSD1Q9NPB0 183 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 CHRAC1Q9NRG0 131 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 PKD2L2Q9NZM6 624 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 CD84Q9UIB8 345 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 SOX13Q9UN79 622 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 PKP3Q9Y446 797 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 TCAF1Q9Y4C2 921 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 TRPM6Q9BX84 2022 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 THADAQ6YHU6 1953 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 MROH6A6NGR9 719 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 PSMD11O00231 422 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 CCL22O00626 93 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 WNT9AO14904 365 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 RPP40O75818 363 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 TM7SF2O76062 418 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 FSBPO95073 299 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 SP9P0CG40 484 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 MYBL2P10244 700 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 GM2AP17900 193 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 MCM3P25205 808 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 NMBRP28336 390 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 HMGCLP35914 325 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 VSNL1P62760 191 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 SGCGQ13326 291 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 ELF2Q15723 593 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF284Q2VY69 593 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF528Q3MIS6 628 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM259Q4ZIN3 620 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 TSTD2Q5T7W7 516 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 ALS2CLQ60I27 953 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 KIAA0895LQ68EN5 471 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 WDR93Q6P2C0 686 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 NEK5Q6P3R8 708 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 CES3Q6UWW8 571 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 SLC36A4Q6YBV0 504 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 RFLNAQ6ZTI6 216 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 CEP128Q6ZU80 1094 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 Q6ZVL8 140 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 NLRP9Q7RTR0 991 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 TRIM69Q86WT6 500 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 IGDCC3Q8IVU1 814 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 FBXO36Q8NEA4 188 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 OR13C4Q8NGS5 318 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 GAB3Q8WWW8 586 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 SNX19Q92543 992 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 NUS1Q96E22 293 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 CFAP36Q96G28 342 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 COQ10AQ96MF6 247 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF778Q96MU6 729 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 LRFN3Q9BTN0 628 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 SLC17A9Q9BYT1 436 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 ZSCAN32Q9NX65 697 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 IL17CQ9P0M4 197 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 CHMP2BQ9UQN3 213 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 MAGEB16A2A368 324 aa8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 MEI4A8MW99 385 aa8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 E7ESA3 106 aa8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 DLL1O00548 723 aa8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 SLC31A1O15431 190 aa8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 IGHV4-34P06331 123 aa8.49□□□□□ -1.05
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