RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623253.4_PAR_Y

CD99-211, Transcript of CD99 molecule (Xg blood group), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD99, Length 573 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y VIPR1P32241 457 aa16.17■□□□□ 0.18
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CDK3Q00526 305 aa16.17■□□□□ 0.18
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y MYL5Q02045 173 aa16.17■□□□□ 0.18
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CCR10P46092 362 aa16.16■□□□□ 0.18
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ACTR1AP61163 376 aa16.16■□□□□ 0.18
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y UBXN1Q04323 297 aa16.16■□□□□ 0.18
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP16.16■□□□□ 0.18
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y NR1D2Q14995 579 aa16.16■□□□□ 0.18
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SKIDA1Q1XH10 827 aa16.16■□□□□ 0.18
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TMCO4Q5TGY1 634 aa16.16■□□□□ 0.18
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y OR4D9Q8NGE8 314 aa16.16■□□□□ 0.18
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y OCIAD1Q9NX40 245 aa16.16■□□□□ 0.18
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y KCTD5Q9NXV2 234 aa16.16■□□□□ 0.18
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TMEM9Q9P0T7 183 aa16.16■□□□□ 0.18
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa16.16■□□□□ 0.18
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ST14Q9Y5Y6 855 aa16.16■□□□□ 0.18
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa16.15■□□□□ 0.18
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PTPRRQ15256 657 aa16.15■□□□□ 0.18
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SNAP47Q5SQN1 464 aa16.15■□□□□ 0.18
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y DDA1Q9BW61 102 aa16.15■□□□□ 0.18
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TAS2R14Q9NYV8 317 aa16.15■□□□□ 0.18
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PHTF1Q9UMS5 762 aa16.15■□□□□ 0.18
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TMEM98Q9Y2Y6 226 aa16.15■□□□□ 0.18
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y RAD1O60671 282 aa16.14■□□□□ 0.17
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y MBD3O95983 291 aa16.14■□□□□ 0.17
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CCDC172P0C7W6 258 aa16.14■□□□□ 0.17
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y THRAP10827 490 aa16.14■□□□□ 0.17
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y FERP16591 822 aa16.14■□□□□ 0.17
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CTPS1P17812 591 aa16.14■□□□□ 0.17
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y LHCGRP22888 699 aa16.14■□□□□ 0.17
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y MIPP30301 263 aa16.14■□□□□ 0.17
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CSF2RBP32927 897 aa16.14■□□□□ 0.17
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y GPR1P46091 355 aa16.14■□□□□ 0.17
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CCDC183Q5T5S1 534 aa16.14■□□□□ 0.17
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ANKS6Q68DC2 871 aa16.14■□□□□ 0.17
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ARFGAP1Q8N6T3 406 aa16.14■□□□□ 0.17
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ZNF599Q96NL3 588 aa16.14■□□□□ 0.17
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y NUDCD1Q96RS6 583 aa16.14■□□□□ 0.17
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SLC38A3Q99624 504 aa16.14■□□□□ 0.17
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