RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 GALNT8Q9NY28 637 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 POP4O95707 220 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 SHBGP04278 402 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 FUT2Q10981 343 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 ELOVL2Q9NXB9 296 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 TRIM43BA6NCK2 446 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 MFSD11O43934 449 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 ITPKAP23677 461 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 DENND6AQ8IWF6 608 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 SMYD1Q8NB12 490 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 ACSS3Q9H6R3 686 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 BMP7P18075 431 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 RPL17P18621 184 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 TNFRSF8P28908 595 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 IDH2P48735 452 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 LILRA4P59901 499 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 PRKG2Q13237 762 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 CKAP2Q8WWK9 683 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 METTL21AQ8WXB1 218 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 SCLYQ96I15 445 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 SLC28A2O43868 658 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 ATP6V1G2O95670 118 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 PKMP14618 531 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 WARSP23381 471 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 GABRB2P47870 512 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 MANFP55145 182 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF671Q8TAW3 534 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 FNDC11Q9BVV2 318 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 IKZF4Q9H2S9 585 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 SEMA3GQ9NS98 782 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 MCIDASD6RGH6 385 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 RFXANKO14593 260 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 BIRC5O15392 142 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 ITGAXP20702 1163 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 MAPKAPK2P49137 400 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 HDDC2Q7Z4H3 204 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 MAGEH1Q9H213 219 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 DPEP3Q9H4B8 488 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 CCNCP24863 283 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 CYP4F2P78329 520 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 RINLQ6ZS11 566 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 TMPRSS11BQ86T26 416 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 NRSN1Q8IZ57 195 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 PCDHB18PQ96TA0 734 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 HEPHQ9BQS7 1158 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 FAM83DQ9H4H8 585 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 RHPN2P1A8MT19 583 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 FSBPO95073 299 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 EPS8Q12929 822 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 AUHQ13825 339 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 TNS4Q8IZW8 715 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 VPS35Q96QK1 796 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 RHOJQ9H4E5 214 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 COX4I1P13073 169 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 ITPKBP27987 946 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 CCR3P51677 355 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 SP2Q02086 613 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 UBXN2BQ14CS0 331 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 NEDD8Q15843 81 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 EML3Q32P44 896 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 SPAG4Q9NPE6 437 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 MYRFQ9Y2G1 1151 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 HDAC3O15379 428 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 BMP6P22004 513 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 ARMC4Q5T2S8 1044 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 SLC26A9Q7LBE3 791 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 TNFRSF25Q93038 417 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 HIC2Q96JB3 615 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 DNAJC11Q9NVH1 559 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 PRG2P13727 222 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 TCEAL5Q5H9L2 206 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 MCMBPQ9BTE3 642 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 IDO1P14902 403 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 ALAS2P22557 587 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 PPIBP23284 216 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 GPM6BQ13491 265 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 ALKBH2Q6NS38 261 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 UXS1Q8NBZ7 420 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 STYXQ8WUJ0 223 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 OR52E6Q96RD3 313 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 ARHGEF4Q9NR80 690 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 EXD2Q9NVH0 621 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 C3P01024 1663 aa20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.2 ms